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生物网络中与疾病相关的子网络搜索研究的中期报告.docx

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生物网络中与疾病相关的子网络搜索研究的中期报告.docx

上传人:niuwk 2024/4/18 文件大小:10 KB

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文档介绍:该【生物网络中与疾病相关的子网络搜索研究的中期报告 】是由【niuwk】上传分享,文档一共【2】页,该文档可以免费在线阅读,需要了解更多关于【生物网络中与疾病相关的子网络搜索研究的中期报告 】的内容,可以使用淘豆网的站内搜索功能,选择自己适合的文档,以下文字是截取该文章内的部分文字,如需要获得完整电子版,请下载此文档到您的设备,方便您编辑和打印。生物网络中与疾病相关的子网络搜索研究的中期报告本研究的目标是使用网络分析技术搜索与疾病相关的生物网络子网络,以揭示疾病的潜在病理生理机制。在本中期报告中,我们介绍了已经完成的工作和下一步的计划。已经完成的工作包括::我们使用公开数据库(如STRING、EpistasisProject和CancerGenomeAtlas)中的蛋白质相互作用、疾病相关基因和突变数据等,构建了一个大规模的蛋白质相互作用网络;同时,我们对该网络进行了清洗和过滤,去除低置信度的边和孤立节点。:我们使用Cytoscape和其插件对构建的网络进行了多种分析和挖掘,包括网络特征分析、模块化分析、功能富集分析等。通过网络模块化分析,我们鉴定了一些生物网络的功能模块,即具有相似拓扑特征和生物学功能的节点组成的集合。:我们使用几种搜索算法,包括最大连通子图算法、神经元演化算法和模拟退火算法,来搜索与疾病相关的生物网络子网络。我们使用公开数据库中的疾病相关基因和突变作为种子节点,并将它们与生物网络进行比对,以寻找疾病相关的生物网络。下一步的计划包括::我们将对搜索到的疾病特异性子网络进行进一步的功能富集和分析,以探究子网络中的潜在病理生理机制。:我们将使用交叉验证和其他方法来验证搜索结果的可信度和重复性。:我们将针对研究成果开发一个在线工具,以帮助生物医学研究人员搜索与感兴趣的疾病相关的生物网络子网络。

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