文档介绍：生物信息学
课程内容
1.     引言/ 分子生物学数据库
2.      BLAST 工具
3.      EST拼接和电子克隆
4.      序列对位排列
5.      分子进化基础
6.      分子系统发育分析方法
7.      基因组分析
8.     专题讲座(6次)
9. 开放讨论(2次)
什么是生物信息学?
80年代末随着人类基因组计划启动而兴起的一门新兴交叉学科
生命科学中的信息科学
基因组相关信息的快速增长(方法与技术需求)
新药开发等(企业需求)
生物信息学(Bioinformatics) 与计算生物学(Computational Biology)
be, N. M. et al., 2001. What is bioinformatics? Methods of Information in Medicine 40: 346-358.
数据挖掘(Data Mining)
关联 Associating
分类 Classifying
建模与模拟 Modeling & Simulating
预测与检验 Predicting & Testing
发生在Wal * Mart 的真实故事
理念:相关联的货物最好摆在一起
问题:啤酒和什么货物关联?
可能的答案:花生米?红肠?……
从上百万张收银单获得的答案:尿布!
数据仓库(Data Warehouse) 和数据挖掘(Data Mining)
数据仓库的定义(): 面向主题的、集成的、稳定的、历史的数据集合,用于支持战略决策制订(而传统的操作型数据库是面向应用的、细节的、可更新的、瞬时的)
1)面向主题的:每个主题对应于一个宏观分析领域
2)集成的:入库之前,要进行加工集成(转成面向主题的)
3)稳定的:几乎不更新(覆盖)
4)历史的:一般要用到过去5-10年的数据
数据挖掘的定义:一种决策支持过程,主要基于人工智能、机器学****统计学等技术,高度自动化地分析原始数据,做出正确的决策
数据挖掘
从大量的、不完整的、有噪声的、模糊的、随机的……数据中, 提取隐含其中的、人们事先不知道的、潜在有用的……信息和知识的过程、技术……
流感的预测
(网上数据挖掘)