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但遗传背景相同的个体间进行正常组织或肿瘤移植则不会发生排斥反应。
进一步研究发现，父本母本为不同品系小鼠的杂交子一代既可接受父本品系的组织移植又可接受母本品系的组织移植，反之，则不然。
其后证明，同种异体间的排斥现象本质上是一种免疫应答，由细胞表面的同种异型抗原所诱导。这种代表个体特异性的抗原称为组织相容性抗原。
至二十世纪中叶证实，机体参与排斥反应的抗原系统多达20个以上，其中引起强烈而迅速排斥反应的抗原称为主要组织相容性抗原，引起较弱和缓慢排斥反应的抗原称为次要组织相容性抗原。
在哺乳动物，编码主要组织相容性抗原的基因位于同一染色体上，是一组紧密连锁的基因群，称为主要组织相容性复合体（major histocompatibility complex, MHC）。
在所有脊椎动物均已检出MHC，而器官移植并非自然现象，提示MHC编码产物的功能绝不仅仅是控制移植排斥反应。现代免疫学认为，MHC产物是参与抗原提呈和T细胞激活的关键分子。TCR识别的配体就是抗原肽与MHC分子形成的抗原肽-MHC复合物。因此，MHC在免疫应答的启动和免疫调节中发挥重要作用。
主要组织相容性复合体(MHC)
即编码主要组织相容性抗原的一组紧密连锁的基因群，定位于哺乳动物某一染色体上特定区域，其编码产物(MHC分子)不仅控制同种移植排斥反应，而且参与抗原提呈和T细胞激活，在免疫应答的启动和免疫调节中发挥重要作用。
Dausset于1958年发现，肾移植后出现排斥反应的患者血清中含有能与供者白细胞发生反应的循环抗体。这些抗体所针对的靶分子即主要组织相容性抗原，其分布在人体所有有核细胞表面， 但因该抗原首先在白细胞表面发现，并且白细胞是进行此类抗原研究的最适宜材料，故称之为人白细胞抗原（HLA）。
不同种属动物的MHC及其编码的抗原系统有不同命名，但其组成、结构、分布和功能等相似。
- 小鼠MHC ( H-2复合体 )
- 人类MHC (HLA复合体)
第一节 人MHC的基因组成及定位
一、人类 HLA复合体
人类MHC亦称HLA (human leuko-cyte antigen)复合体，位于第6号染色体短臂。全长3600kbp，239个基因座位中130个有功能。