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一般来说，无论何种类型的细胞工程技术，起始阶段均波及外植体取材、灭菌、接种与培养等基本过程。
§1、外植体的选择和灭菌
一 外植体的选择
(一) 外植体的基因型
不一样种类的植物
同一植物的不一样器官
对诱导条件反应是不一致的，有的部位诱导分化的成功率高，有的部位却很难脱分化，或者再分化频率很低
单子叶植物不易诱导器官发生。
b. 木本植物较难诱导。
c. 存在基因型差异（如番茄29%~63%）
d. 开始生长季节取材容易诱导。
外植体种类及基因型
(二)外植体的部位
常用的外植体种类：
①茎尖（园艺植物组织培养中应用最多，繁殖率高，不易发生遗传变异，但取材有限）
②茎段（采用嫩茎的切段增进腋芽萌发，取材容易）
③叶（幼嫩叶片组织通过愈伤组织或不定芽分化产生植株，取材容易，操作以便，但易发生变异）；
④花球和花蕾
⑤种子、根、块根、块茎、花瓣、胚等。
对于大多数植物来讲，茎尖是最佳的部位，由于其形态已基本建成，生长速度快，遗传性稳定，也是获得无病毒苗的重要途径，但茎尖往往受到材料来源的限制，而采用茎段可处理培养材料局限性的困难。
在选择植物外植体进行组织培养时，还规定考虑待培养材料的来源与否有保证，与否容易成苗；同步要考虑到该外植体，尤其是通过脱分化产生的愈伤组织，与否会引起不良变异，丧失原品种的优良性状。