第八章-转录调控的信息学分析.ppt

文档介绍：生物信息学
第八章 转录调控的信息学分析
汕头大学医学院许丽艳
生物信息学
学****提纲
重点
转录因子结合位点的识别及其定位的基本概念和表示方法
转录因子结合位点识别的操作步骤和相关算法的使用
转录因子结合位点定位预测软件的使用
学****提纲
难点
转录因子结合位点识别的操作步骤和相关算法的使用
转录调控相关数据库
熟悉
第一节引言
(Introduction)
、基因转录调节的基本模式
基因转录调节模式图
二、基因转录调节机制的研究方法
实验方法
荧光素酶报告基因(luciferase report gene)
凝胶迁移(electrophoreticmobility shift assays)
染色质免疫沉淀(ChIP)
DNase 足迹法(DNase footprinting)
信息学分析
第二节
转录因子结合位点的信息学预测方法
(Prediction of Transcriptional Factor Binding sites)
一、转录因子结合位点的表示方法
(一)共有序列(consensus sequence)