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正确、规范采集和运输标本
经过直接显微镜查见病原体，或检出病原体抗原成份，或经过分子生物学方法检测到病原体核酸，结合病人病史、症状、体征，可作出初步诊疗
同时，深入对病原体进行分离和判定，确定感染病原体类型
对细菌和真菌感染要进行抗生素敏感试验
诊疗临床病原体检查
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标本采集、运输和检验方法
一．标本采集和运输
全部采集标本均置于无菌或清洁容器中，不能接触消毒剂和抗菌药品。
血液：普通在发烧早期和高峰期采集，如已用抗生素，则在下次用药之前采集。成人采血量为每次10-20毫升，-5毫升。专用血培养瓶。
血标本采集次数 依据研究，仅采血一次分离率约占80%，培养2次分离率约占90%，而培养三次分离率约占99%。
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多瓶接种 ①厌氧菌菌血症占菌血症5-15%, ②有10%菌血症不是单一微生物引发, ③长久使用抗生素患者可展现L型菌. ④免疫低下患者易发生真菌感染；依据情况做二种血培养瓶培养,需氧和厌氧或需氧和L型培养。
标本采集操作 应注意严格无菌操作，防止污染杂菌。
标本送检 接种血液样本培养瓶应马上送检，如因某种原因不能马上送检时，勿放冰箱存放。
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尿液 惯用清洁中段尿。对于厌氧菌采取膀胱穿刺法搜集、无菌厌氧小瓶运输。
粪便 取脓、血、粘液送检，排便困难及婴幼儿可用直肠拭子采集，依据检验目标选取不一样运输培养基及分离培养基提升检出率。
呼吸道标本 鼻咽拭子、痰、纤支镜采集物，经气管采集分泌物可防止正常菌群污染，是确定下呼吸道感染理想标本。
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脑脊液及其它体液 对于脑脊液常见病原菌如脑膜炎奈瑟菌、肺炎链球菌、流感嗜血杆菌，抵抗力弱，采集后应马上接种。对于胸、腹水和心包积液因为含菌量少宜接种量大或按血培养处理。
眼、耳标本 用无菌拭子采样，可用角膜刮屑。
泌尿生殖道标本 可用尿道口分泌物、外阴糜烂面分泌物、宫颈口分泌物和前列腺液等。
创伤、组织和脓肿标本 首先清创，用无菌拭子取材。
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悬滴法用于病原体动力观察，暗视野或相差显微镜用于病原体生长、形态、运动方式。
染色检验：革兰氏染色用于细菌和真菌检验；抗酸染色用于结核菌及放线菌检验；墨汁染色用于新型隐球菌检验。
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主要用于不易培养微生物快速诊疗，用已知抗体，利用免疫荧光、酶联免疫技术等检测标本中抗原。
主要是PCR和DNA探针杂交检测标本中病原体。
细菌培养，将标本接种对应培养基上，依据菌落形态、生化反应判定细菌；不易培养微生物进行细胞培养。
检测病原体刺激机体产生抗体，IgM型抗体检出为新近感染指标。
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细菌耐药性检验
抗菌药品作用机制
干扰细菌细胞壁合成，使细菌不能生长繁殖。
影响细菌细胞蛋白质合成，使细菌丧失生长繁殖物质基础。
破坏核酸代谢，妨碍遗传信息复制。
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抗生素广泛使用所造成抗生素选择性压力使医院感染控制面临严峻挑战，所以对细菌耐药性发生机制和耐药监测便成为临床微生物检测中一项主要工作。
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抗菌药品选择性压力
耐药菌株极少
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耐药菌株为主
抗生素暴露
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