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大部分原始有机物质被微生物分解和选择性吸收。剩余的组分和参与的微生物残体一起，经还原、缩聚等作用形成了腐植质和干酪根。
成岩阶段有机质的演变就是指沉积有机质在沉积物固结成岩中，在低温低压条件下所经历的以微生物改造为主的演化过程。该阶段以大量褐煤和干酪根形成为特点。
4-1 微生物的作用
一 .微生物的简介
微生物大多数为单细胞或不分化、分化不明显的多细胞。
原核生物（细菌，蓝藻等）
原生生物
真核生物 （原生动物 ，藻，细菌，黏菌）
对地质体其改变作用的主要是异养腐生细菌和真菌。
细菌按其生活环境可分为喜氧细菌和厌氧细菌
光合生物
矿物
有机物
被利用
产生
微生物作用
中国地质大学（武汉）西区南望亭
一般在在沉积物上部几十米范围内微生物较为活跃，但是随着深度增加急剧减少，而且可以由好气型细菌活动为主转变为嫌气型细菌活动为主。pH值降到3细菌活动基本停止。
深度（CM）
嫌气细菌
好气细菌
嫌气/好气
0~3
1 160 000
74 000 000
1:64
4~6
14 000
314 000
1:21
14~16
8 900
56 000
1:6
24~26
3 100
10 400
1:3
44~46
5 700
28 100
1:5
66~68
2 300
4 200
1:2
加利福尼亚州圣地亚哥湾近代沉积中细菌含量
（据 ，Anderson ，1936）
三、微生物的代谢机制
新陈代谢是生物最基本的特征，提供生物活动的基本动力。通过新陈代谢生物将外界的营养物质转化成生物体本身，并排除废物，得以生长繁殖。
，可分解利用不同的有机物。
。
1
2
3
4
5
6
根据“异养假说”，异养微生物是地球生命的先驱。
分解
在“三足鼎立”的生态系统中，异养微生物是必不可少的“分解者”。
地球上生物所需的能量和营养物质完全来自能光合作应的绿色植物和光合微生物，但它们都需要唯一碳源——CO2和唯一能源——阳光。
%，如果只出不进，远远不能满足需要。
大气中的二氧化碳的补充90%来源于真菌和细菌分解代谢把有机碳矿化为CO2。