文档介绍：第十章 MicroRNA微阵列分析
黄仲曦
基础医学院肿瘤研究所
《微阵列设计与分析》
长度约22个核苷酸的非编码RNA;人类目前发现700多个。
通过与靶mRNA的3’UTR结合,降解mRNA或抑制蛋白翻译。
一个microRNA可以调控几十上百个基因;反之,多个microRNA调控可以同一个基因。
在生命的各个过程中都发挥重要作用(例如,干细胞、胚胎发育、肿瘤、心血管疾病等)。
microRNA简介
MicroRNA芯片
MicroRNA expression profiling of human metastatic cancers identifies cancer gene targets. J Pathol. 2009,219:214-21.
43 对原发肿瘤(10 结肠, 10 膀胱, 13 乳腺, 10肺癌) 和相应的淋巴结转移瘤
microRNA合成与功能
microRNA在动物中的加工过程。两条途径:一条来自独立基因,另一条来自内含子。
酶:浅绿色椭圆
缩写:
pri-miRNA = 前microRNA转录本
pre-mRNA = 信使RNA前驱物
pre-miRNA = microRNA前驱物
miRNA = microRNA
miRNA* = 反义microRNA
miRNP = microRNA核糖核蛋白复合物
http://en./wiki/MicroRNA
约22个核苷酸
/
miRBase是最权威的microRNA数据库,大约每半年更新一次。
>hsa-let-7d MIMAT0000065
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>hsa-let-7c MIMAT0000064
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>hsa-let-7a-2* MIMAT0010195
>hsa-let-7b* MIMAT0004482
>hsa-let-7e* MIMAT0004485
>hsa-let-7e MIMAT0000066
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>hsa-let-7d* MIMAT0004484
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>hsa-let-7b MIMAT0000063
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>hsa-let-7a MIMAT0000062
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>hsa-let-7a* MIMAT0004481
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>hsa-let-7c* MIMAT0004483
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