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长牡蛎基因组fosmid文库的构建及分析.pdf

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长牡蛎基因组fosmid文库的构建及分析.pdf

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长牡蛎基因组fosmid文库的构建及分析.pdf

文档介绍

文档介绍:长牡蛎基因组文库的构建及分析张琳琳唬罾,许飞梁8,王晓通殴测序和序列分析。主要结果构建了长牡蛎文库,该文库包含个克隆,插入片段平均大小分布在.,平均插入片段约为嘌天的&;泄蒲г貉芯可褐泄本摘要:长牡蛎是世界海水养殖的重要品种,是进化地位重要但研究相对较少的冠轮动物超门的代表种,但目前对长牡蛎基因组的信息所知甚少。快速发展基因组测序技术为长牡蛎基因组的深入研究提供了可行性。本研究对构建的第一个报道的长牡蛎文库进行了末端酶切图谱表明该文库在传代过程中没有插入片段的丢失和重排,具有传代稳定性。研究对文库部分克隆测序懿庑虺ざ任骄ざ任.,长牡蛎基因组大小为。治觥;趂┒瞬庑颍肨等软件对长牡蛎的文库末端测序序列和,鮁序列进行了微卫星分布和进化动力分析。分析结果表明为微卫星在长牡蛎基因组中广泛存在,共个。这些微卫星中有个两端侧翼序列大于,是微卫星标记开发的候选。此外,对三碱基重复序列的分析表明,的三碱基重复序列比文库所代表的基因组序列受到更大的选择压力,馗粗辛礁互补模体有个具有显著差异,而末端序列中只有觥A硪环矫妫芯糠⑾植完美微卫星的突变率与重复序列长度成反比并有重复序列位置差异,与微卫星进化的复制打滑机制相一致。长牡蛎基因组其他重复序列的分析。用砑圆庑蛐蛄薪辛舜重复序列的分析,其中重复单元长度在个重复序列长度占总卫星长度的.%,重复单元大于恼ァT诖笥的重复单元中,重复单元在基因组中拷贝数最多,,但多态性位点较多。另一方面,用对长牡蛎基因组散在重复序列分析,共找到条散在重复序列,占测序总长度的.%。同源基因的注释。榷越峁砻鳎庑蛐蛄兄条序列与库具有相似性关键词:长牡蛎;文库;微卫星;重复序列作者简介:张琳琳,女,博士研究生,专业方向:水产养殖学。簔畄產甮通讯作者:张国范校芯吭薄:畄辏甤

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