文档介绍：Slide #1
讨论主题:
SCAN采集方式的适用性
各种数据采集参数对数据的影响
Scan 采集原理
Slide #2
12
50
100
150
200
250
300
11
10
9
8
7
6
Time [minutes]
Mass [daltons]
质谱数据是三维的
Slide #3
Time ->
Abundance
0
2000000
4000000
6000000
8000000
1e+007
+007
TIC:
总离子色谱
Slide #4
M/Z
Abundance
82
166
182
303
50
100
150
200
250
1000000
Scan 32 ( min):
M/Z
Abundance
82
166
182
303
50
100
150
200
250
1000000
Scan 33 ( min):
M/Z
Abundance
82
166
182
303
50
100
150
200
250
1000000
Scan 34 ( min):
M/Z
Abundance
82
166
182
303
50
100
150
200
250
1000000
Scan 35 ( min):
Time
Abundance
2000000
4000000
6000000
8000000
TIC:
32
33
34
35
31
36
30
总离子色谱
Slide #5
MASS
TIME
MS
采集参数
质量范围
. 35 - 350
A/D 's
. N = 2
or 4 samples
per amu
Scan high low, amu steps
Signal averaging with 2 determinations per amu data point
MASS
TIME
质量峰检测
Slide #6
影响扫描时间的因素:
平均每 amu 增加数据点的数目(sampling rate)
扫描质量范围
离子检测的真实数目(scan threshold)
每个色谱峰通过5-10次扫描可以很好地定性!
每个色谱峰通过10-20次扫描可以很好地定量!
MASS
TIME
程序时间
回扫时间
扫描时间
扫描循环时间
数字式扫描过程
Slide #7
1E2
2E2
3E2
4E2
5E2
6E2
7E2
8E2
9E2
1E3
1E3
ABUNDANCE
M/Z
阈值
3
2
1
4
5
1
2
3
4
5
3
2
1
4
5
STORES: , 1137
用五个邻近的数据点平滑
确定中心质量(质量峰最大).
质量中心的水平应超过质量阈值
数据文件同时储存质量和丰度
质量峰检测(续)
Slide #8
阈值过高
82
182
M/Z
相对强度
M/Z
相对强度
82
303
182
阈值设置适当
阈值
Slide #9
MS 需考虑的事项
扫描速度/循环时间
GC 需考虑的事项
峰宽
Data 需考虑的事项
信号: 噪声比率
高斯峰形
峰倾斜
阈值
Slide #10
讨论主题:
选择离子检测(SIM)与扫描的区别
SIM 采集参数如何影响数据
SIM 方式如何进行数据采集
选择离子检测的原则