文档介绍：生物统计和R语言应用培训班
2013年11月11-15日
(第一轮通知)
一、组织机构
主办单位:中国科学院植物研究所
承办单位:中国科学院植物研究所文献与信息管理中心学术交流与培训部
筹备组成员:组长:崔金钟
成员:侯淑琴、傅燕凤、刘凤红
二、培训班目的和宗旨
生物学研究越来越离不开统计学。统计学不仅仅是一种工具,一种数据处理的方法。针对不同的研究对象应该采用怎样的调查方法或者怎样的实验设计方法,应该用什么样的统计学方法进行数据处理、分析和解释,都将对研究的过程和结果产生重要的影响。从问题,实验设计、到选择合适的统计方法,再到数据分析结果的解释,本身就是很重要的研究过程和研究结果。不仅要掌握数据处理的方法,更需要理解每种方法所蕴涵的统计学的思想,而后者常常容易被忽视,甚至导致统计方法的滥用。本班拟从问题出发,进行实验设计、选择合适的统计方法,再到数据分析结果的解释的过程中,讲授常用的生物学实验设计和统计方法。
R语言是一个用于统计计算和统计制图的优秀软件。尽管R语言的历史不长,但以其开源、自由、免费等特点已经风靡全球,逐渐成为科学家的第二语言。目前R的使用者呈几何级数增加。R语言也逐步受到国内科研工作者,特别是青年学者和研究生的青睐。近年来随着数据分析方法和数学模型在生态学和生物多样性研究中的迅速发展,传统的统计软件已经很难满足迅速发展的数据分析要求。R软件以其灵活、开放、易于掌握、免费等诸多优点,在生态学和生物多样性研究领域迅速赢得研究者的青睐。然而,与国外相比,R软件在国内生态学和生物多样性研究中的应用还相对较少。目前,国内生态学界使用R的学者越也来越多,特别是青年学者和研究生。近年来,沿着纬度梯度在我国东部森林区的建立数十个森林大样地构成中国森林生物多样性监测网络(Chinese Forest Biodivsity work, CForBio)。为了分析大样地庞大数据的需要,R已经成CForBio研究人员为最主要的分析的工具。目前CForBio所发表50多篇SCI文章基本上都是引用R作为数据分析工具,这些成果的发表也促进R在国内生态学界的推广和应用。
为了让从事生物学科研工作者了解和使用R,中国科学院植物研究所在2013年11月10日到15日再次举办“生物统计和R语言应用培训班”。此次培训班目的在于让R的初学者尽快掌握R的用法并熟练应用到自己的研究当中。
三、参加人员要求
参加人员需具备一些基本的统计学基础知识
四、适合的参加者
从事生态学研究的老师及研究生和生物多样性相关研究的生态学者。包括研究者、硕士、博士研究生、博士后等。
五、授课内容
主讲人
授课内容
时间
王世畅博士、助理研究员
(中科院植物所)
生物统计学基础知识
常用统计方法简介
实验设计、数据处理及结果推断
一天
刘国方博士
(中科院植物所)
1. R语言简介,R语言数据类型、结构、流程控制、循环、自定义函数;
两天
2. R语言基础函数讲解,批量数据的统计计算;
3. R语言绘图(低阶作图和高阶作图);
4. R语言文本数据操作(正则表达式、文本操作有关的函数)及实例讲解。
六、培训班时间
2013年11月11日 14:00 报到:12-14日上课;15日培训班结束
七、培训班语言及条件
中文讲课、