文档介绍：中文摘要关键词:小分子水簇;溶菌酶;分子动力学模拟;相互作用索,已经成为簇科学研究领域的热点。水分子簇的弱作用普遍存在于生物大分子互作用,探究了溶菌酶肿铀亍⑷芫敢凰街植煌逑抵腥芫傅亩ρ性质,为进一步深入研究水通道蛋白与水分子簇的作用机理奠定基础。酶与水之间的氢键作用较弱,仅亮氨酸捅彼胨涞南嗷プ饔媒强。溶菌酶周围的水的分布较纯水松散。对溶菌酶非极性腔内丝氨酸和缬氨溶菌酶一小分子水簇体系的分子动力学模拟研究表明,溶菌酶和水分子簇之同,小分子水簇破坏了蛋白质的构象,为进一步阐释小分子水簇对生物化学反应近年来,有关小分子水簇的结构、分子行为、氢键网络等物理化学性质的探体系中,对生物体系中水分子簇间接环境的功效研究可望为深层次揭示化学、生命科学和信息科学等领域的本质问题提供有利依据。本文中采用分子动力学方法研究了小分子水簇与模型蛋白溶蔺酶之间的相溶菌酶一水体系的动力学研究表明,溶荫酶在普通水环境中构象稳定。溶菌酸的水化层分析,证实了丝氨酸为非极性腔内的活性位点。间的氢键相互作用较普遍,溶菌酶在小分子水簇溶剂化作用下构象发生了较大变化,溶菌酶解旋,三级结构破坏,活性丧失,从理论方面解释了本课题组纳米水分子簇能够抑制大肠杆菌的生长的结论。径向分布函数及水化层分析表明,小分子水簇集中分布在溶菌酶周围第一水化层内,并且分布比较松散。综上,小分子水簇对溶菌酶的溶剂化效应较普通水的溶剂化效应有较大不的影响奠定了基础。■
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⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯水通道蛋白简介⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯水通道蛋白的分布与功能⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.水通道蛋白的分子结构⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.水分子簇的结构⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。.肿哟匮芯拷埂蛋白质与水之间相互作用的研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..溶蔺酶简介⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.分子模拟方法简介⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.本课题研究内容及选题意义⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..第二章溶菌酶与不同水溶剂相互作用的分子动力学研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯分子动力学过程简介⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯...⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。.芫浮.》肿铀氐慕!.胀ㄋP汀计算平台⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.
第三章结果与讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..能量、温度分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.八惴治觥二硫键变化⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.二面角分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..⒔帷第四章结论与建议⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯本文总结⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.未来工作的建议及展望⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯发表论文和参加科研情况说明⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯致谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.■⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.‘●
水通道蛋白简介第一章文献综述水通道蛋白的分布与功能运是如何实现的是生命科学中一个非常重要的基本问题。一方面水通过简单渗透教授对水通道蛋白膜的研究为水与生物第一次确定无疑地鉴定出了水通道蛋白【。研究指出,水分子的跨膜输运是通过细胞膜上的一种水通道蛋实现的。水通道蛋白大大有利于水分中性环境动态平衡、消化、体温调节等。水通道蛋白广泛存在于自然界的植物、家族。~ǖ赖鞍资且基酸序列同源性。一个水通道蛋白分子每秒钟可以允许亿个水分子通水是生命的重要要素,其对于细胞的新陈代谢、细胞内外环境的稳