文档介绍：第十二章实验设计
一项关于在干旱地区生长的一种杨树(Populus euphratica),在土壤中的水分逐渐丧失后,其基因表达、蛋白谱、生态生理学及生长性能等方面产生可逆性改变的研究。作者在本实验的5个时间点上(H5为对照),用qPCR方法度量了该杨树叶子中的三个基因的转录丰度比[83],表中给出的为阵列数据:
GenBank ID
基因
H1
H2
H3
H4
H5
AJ 780 423
半胱氨酸蛋白酶
AJ 780 698
环核苷酸和钙调节的离子通道
AJ 777 362
核糖体蛋白
借用上述数据,以三个基因作为三个区组,计算在5个时间点上转录丰度比差异是否显著?
答:随机化完全区组实验设计方差分析的程序,类似于两因素交叉分组实验设计。以下是本题的程序和结果:
options linesize=76 nodate;
data poplar;
do block=1 to 3;
do time=1 to 5;
input trans @@;
output;
end;
end;
cards;
;
proc anova;
class block time;
model trans=block time;
run;
The SAS System
The ANOVA Procedure
Class Level Information
Class Levels Values
block 3 1 2 3
time 5 1 2 3 4 5
Number of observations 15
The SAS System
The ANOVA Procedure
Dependent Variable: trans
Sum of
Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F
Model 6
Error 8
Corrected Total 14
R-Square Coeff Var Root MSE trans Mean
Source DF Anova SS Mean Square F Value Pr > F
block 2
time 4
从上表中的结果可以看出,如果按随机化完全区组设计进行分析,不同时间点之间的差异不显著。
归纳成一般格式的方差分析表如下:
变差来源
平方和
自由度
均方
F
P
区组
333 33
2
666 67
9
时间点
666 67
4
666 67
6
误差
333 33
8
666 7
总和
333 3
14
测定了新疆维吾尔、哈萨克、柯尔克孜族乡村不同年龄的男生(n =100),50米跑的平均成绩(s),结果如下[10]:
年龄/a
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
维吾尔
哈萨克
柯尔克孜
该试验的目的,是为了推断不同民族间,男生50米跑的平均成绩差异是否显著。首先判断该试验属于一种什么设计,然后再计算。
答:该试验为随机化完全区组设计,年龄为区组。程序不再给出,下面只给出结