文档介绍:中南大学信息科学与工程学院HP计算集群使用手册
盛羽(******@.)
陈钢(@)
2008年10月31日
本手册的最新版本请访问.
为了满足学院内各科研项目对高性能计算资源的要求,在湖南省和学校网络中心等部门的支持下,学院新购入惠普高计算服务器和相关存储设备(以下简称HP集群)。为了方便大家的使用,规范设备的维护和管理,请大家在使用该计算资源前仔细阅读本手册。
集群概况
高性能计算集群的软硬件环境都比传统的服务器复杂,为了便于后续的介绍,先在此对HP集群的软硬件基本情况做大致介绍。
硬件配置
HP集群的管理节点和计算节点的基本硬件配置如下表所示:
节点类型
型号
处理器
内存
管理节点
HP ProLiant DL380R05
Intel E5430×2
DDR2-667 8GB
计算节点
HP ProLiant BL460c
Intel E5430×2
DDR2-667 8GB
图表 1 HP集群硬件配置
在下面的介绍中16个计算节点分别简称为节点1,节点2……节点16。
HP集群的存储设备配置如下:
型号
MSA60 2U LFF JBOD
硬盘型号
HP750GB 3G SATA ” MDL HDD
硬盘数量
7
RAID配置
RAID5+1
可用空间
图表 2 HP集群存储设备配置
存储系统分为划分为两个分区,作为NFS挂载在Linux节点的/data和/scratch目录下。如有需要可以向管理员申请权限。
软件配置
节点1至节点4的操作系统为Windows Server 2008 64bit,节点5至节点16的操作系统为RHEL x86_64。
RHEL 5.、JDK等基本的编译和开发工具,以及R、Matlab2008a、NS2等常用软件,并能提供MPI、OpenMP等并行计算环境。
系统中的软件会根据用户实际需求逐步添加,若有特殊需求请联系管理员。
网络拓扑
HP集群的网络拓扑结构如下:
-16
Windows节点
图表 3 HP集群网络拓扑图
对Linux节点(即节点5至节点16)的访问只能经过管理节点。Windows节点(即节点1至节点4)的访问可以直接使用远程桌面访问。节点访问和登录的具体过程稍后详述。
集群帐号申请
在使用本集群值钱需要向管理员申请帐号,获得相应权限后方可使用。本集群的帐号仅供教师申请,教师帐号可以分配给所辅导的学生使用。
申请帐号请如实填写下面这份表格(双击打开后填写),经导师签字后交到计算机楼302盛羽老师处。
集群基本使用
集群的使用与普通的服务器并没有本质差别。现在本集群中Linux节点的访问主要通过SSH,Windows节点的访问方式为远程桌面。鉴于Windows在科学计算中使用较少,并且一般读者都对Windows比较熟悉,所以本章以介绍L