文档介绍：中南大学信息科学与工程学院HP计算集群使用手册盛羽(******@.)陈钢(@)://. 为了满足学院内各科研项目对高性能计算资源的要求,在湖南省和学校网络中心等部门的支持下,学院新购入惠普高计算服务器和相关存储设备(以下简称HP集群)。为了方便大家的使用,规范设备的维护和管理,请大家在使用该计算资源前仔细阅读本手册。集群概况高性能计算集群的软硬件环境都比传统的服务器复杂,为了便于后续的介绍,先在此对HP集群的软硬件基本情况做大致介绍。硬件配置HP集群的管理节点和计算节点的基本硬件配置如下表所示:节点类型型号处理器内存管理节点HPProLiantDL380R05IntelE5430×2DDR2-6678GB计算节点HPProLiantBL460cIntelE5430×2DDR2-6678GB图表1HP集群硬件配置 在下面的介绍中16个计算节点分别简称为节点1,节点2……节点16。 HP集群的存储设备配置如下: ”MDLHDD硬盘数量7RAID配置RAID5+,作为NFS挂载在Linux节点的/data和/scratch目录下。如有需要可以向管理员申请权限。软件配置节点1至节点4的操作系统为WindowsServer200864bit,。RHEL5.、JDK等基本的编译和开发工具,以及R、Matlab2008a、NS2等常用软件,并能提供MPI、OpenMP等并行计算环境。系统中的软件会根据用户实际需求逐步添加,若有特殊需求请联系管理员。网络拓扑HP集群的网络拓扑结构如下:-16Windows节点图表3HP集群网络拓扑图对Linux节点(即节点5至节点16)的访问只能经过管理节点。Windows节点(即节点1至节点4)的访问可以直接使用远程桌面访问。节点访问和登录的具体过程稍后详述。集群帐号申请在使用本集群值钱需要向管理员申请帐号,获得相应权限后方可使用。本集群的帐号仅供教师申请,教师帐号可以分配给所辅导的学生使用。申请帐号请如实填写下面这份表格(双击打开后填写),经导师签字后交到计算机楼302盛羽老师处。集群基本使用集群的使用与普通的服务器并没有本质差别。现在本集群中Linux节点的访问主要通过SSH,Windows节点的访问方式为远程桌面。鉴于Windows在科学计算中使用较少,并且一般读者都对Windows比较熟悉,所以本章以介绍Linux为主,在章末会简要介绍Windows节点的登录。 Linux节点本章将从四个方面对本集群中Linux节点的使用做基本介绍,这四个方面分别是:远程登录、文件传输、软件使用以及作业提交。为了方便用户,本章会介绍相应的免费软件。相关软件可以从。远