谢尚潜博士论文.ppt

文档介绍：ImprovingpeptideidentificationfortandemmassspectrometrybyincorporatingtranslatomicsinformationE-mail:******@Chuan-LeXiao(肖传乐)中山大学眼科学国家重点实验室Background13stepsinproteinidentification:,13,4113−4119Background1Translatomics(Ribosomeprofiling,Ribo-seq)Sequencingread50-150bpMapping困难:基因组序列太长,需要比对reads量大。计算方法要求:•速度和准确度•可接受的内存耗用目前测序产生数百万个短读序列(reads),将每个read在基因组上准确定位。Background1高灵敏度!高速度!高精度!FANSe::ARobustandCost-EfficientAlignmentToolforQuantitativeNext-:蛋白的鉴定效率低(约10-30%)m/z峰强度峰强度峰强度?高鉴定能力和高精度,广泛使用性且可靠性高ProVerB:Background1i=A,C,….j=A,C,….1)配对氨基酸与峰强度统计分析(b,y离子强度矩阵)Background1