文档介绍：11 1
中国农业科学 2011,44(5):1015-1021
Scientia Agricultura Sinica doi: .0578-
奶牛瘤胃微生物 BAC 文库中 ACCase 基因的筛选
与生物信息学分析
赵圣国 1,王加启 1,卜登攀 1,刘开朗 1,朱雅新 2,周凌云 1
(1 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/动物营养学国家重点实验室,北京 100193;2 中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室,
北京 100080)
摘要:【目的】从奶牛瘤胃微生物 BAC 文库中筛选含乙酰 CoA 羧化酶(ACCase)基因的克隆子,并对其全长
测序和生物信息学分析。【方法】利用PCR 序列驱动筛选法,从瘤胃微生物 BAC 文库中筛选 ACCase 基因,鸟枪法
测定基因序列后,进行基因注释、比对和系统发育分析。【结果】ase 基因的克隆(U12),其插
入片段序列(URE12)全长 43 358 bp,GC 含量为 %,经 GeneMark 程序预测含有 38 个基因,经 Signature
程序预测属于变形菌门。ACCase 基因(Acc-32)编码 159 个氨基酸,与 Elusimicrobium minutum 的 ACCase 基因
具有 41%的相似度,编码蛋白分子量为 kD,等电点为 ,在距离 Acc-32 上游的 33 kb 区域,发现一段
能编码 ACCase 连接酶的基因。Acc-32 的结合位点氨基酸残基为 GQVICVIEAMKVFNELKA,系统发育分析表明 Acc-32
属于ε-变形菌纲。【结论】ase 基因的序列片段,并且 ACCase 基因具有新的结构特征。
关键词:瘤胃微生物;BAC 文库;乙酰 CoA 羧化酶;基因注释;生物信息学
Screening and Bioinformatics Analysis of ACCase from a
BAC Library of Dairy Cow Rumen Microbiota
ZHAO Sheng-guo1, WANG Jia-qi1, BU Deng-pan1, LIU Kai-lang 1, ZHU Ya-xin2, ZHOU Ling-yun1
(1Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences /Key Laboratory of Animal Nutrition, Beijing 100193;
2Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100080)
Abstract: 【Objective】 The objective of the experiment is to screen, sequence and bioinformatical analyze the ACCase clone
from a BAC library of the da