文档介绍：,. .
吗啡急性处理小鼠的微阵列数据分析和生物标记识别
张文华,王燕平
摘要:目的通过生物信息学方法,识别吗啡急性处理小鼠的差异表达基因及其富集的通路。方法从高通量
基因表达数据库下载吗啡急性处理小鼠的微阵列数据,并调用语言..软件的质量控
制包..对数据样本进行质量控制分析,运用语言的微阵列数据线性模型识别吗啡处理前后的
差异表达基因,采用表达分析系统检测算法进行差异表达基因的通路富集分析。结果吗啡急性处理小鼠的微阵
列基因表达数据具有良好的均一性和阵列强度相似性,识别得到、、、和等个
差异表达基因和癌症、黑素原生成和丝裂原活化蛋白激酶信号等条代谢通路。结论所识别的差异表达基因和
代谢通路成为吗啡急性处理小鼠潜在的生物标记。
关键词:吗啡;小鼠;微阵列分析;基因表达;生物学标记;功能富集分析
中图分类号:. 文献标志码: :...—...
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吗啡具有镇痛、止咳、降低血压等作用。同时, 表达情况分析吗啡对小鼠组织进行急性处理前后基
吗啡的过量吸入会形成神经系统分子和细胞的适应因表达的差异,并对差异表达基因进行代谢通路的
性,进而导致对药品的耐受、物理依赖和成瘾口。因富集分析,为研究吗啡对人体的作用机制提供参考。
此,深入研究吗啡对人体的生理作用机制,有助于对
其高效地利用。生物信息学从核酸和蛋白质序列出材料与方法
发,分析序列中包含的结构功能的生物信息,可部分. 基因表达谱数据本文从高通量基因表达数据库
代替大量的分子生物学工作,具有快捷、高效、覆盖下载一数据样本表
面广等优势。本研究通过微阵列芯片数据的基因达微阵列数据,采用平台进行检测,分析流程见
图。同时从数据库下载原始文件以及该平台探针注释
基金项目:年国家医学教育发展中心课题项目———
作者单位:黑龙江齐齐哈尔,齐齐哈尔医学院附属第三医院麻醉科邮编;济南,济南循证医药科技开发中心科研
作者简介:张文华,女,硕士,副主任医师,主要从事麻醉技术及麻醉用药研究
通迅作者.
天津医药年第卷第期
存在于神经元中,通过影响神经突触的可塑性产,,:.
生对吗啡的病理性镇痛耐受作用。丝裂原活化蛋】./.——
白激酶信号通路在前额叶皮质磷酸化过程中导致细【——】://.//—
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胞外调节蛋白激酶表达降低,进而参与吗啡依赖的,,,.
形成和戒断反应,造成吗啡成瘾”。此外,丝裂原活—
化蛋白激酶信号通路具有信号转导作用,因此其在.,,
细胞的增殖、分化及凋亡等生化反应过程中起到重:.
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要作用。而鞘脂类在脂筏的形成过程中扮演着重要
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角色,其代谢过程与细胞的信号转导有关。同时, ,,:.
焦点黏附通常在焦点黏附激酶的作用下发生,该过】,,.—
程可以间接反映细胞与细胞外基质之间的信号传递, .
与细胞迁移、侵袭、存活等生物过程密切相关【。代谢,,:—.
通路的富集反映出,吗啡急性处理后可能发生丝裂】,,.
原活化蛋白激酶信号转导、鞘脂的代谢和焦