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生物信息学课件.ppt

上传人:bai1968104 2019/4/16 文件大小:636 KB

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文档介绍

文档介绍:揭开生命奥秘的新兴交叉学科 生物信息学主讲人:11023205刘哲计算机学、计算机网络医学生物学、分子生物学生物信息学数学、 统计学生物信息学和其它学科的关系生物信息学是一门边缘学科,它位于生物、医学、计算机、数学等多个领域的交叉点上生物信息学内容生物信息学的涵义生物信息学的基本研究方法生物信息学的主要研究内容人类基因组计划的完成,后基因组计划及蛋白质组计划的实施,出现和积累了与日俱增的信息,生命科学将全面进人信息提取和数据处理的全新阶段。早在20世纪80年代末,在美国工作的马来西亚华人林华安博士就认识到将计算机科学与生物学结合起来的重要意义,并首次提出了“生物信息学(bioinformatics)”的概念,并因此而获得“生物信息学之父”的美誉。生物信息学的涵义生物信息学著名科学家、诺贝尔奖获得者Gilber提出:“传统生物学解决问题的方式是实验的。现在,基于全部基因都将知晓,并以电子可操作的方式驻留在数据库中,新的生物学研究模式的出发点应是理论的。一个科学家将从理论推测出发,然后再回到实验中去,追踪或验证这些理论假设”。生物学属于实验性的,那就称它为实验生物学。新的学科领域:生物学与计算机科学、信息科学和统计科学相结合的领域,也称其为理论生物学,这是生命科学走向现代化的一个重要标志。生物信息学一、生物信息学的涵义生物信息学是用数理和信息科学的观点、理论和方法,以计算机为工具对生物信息进行收集、加工、储存、传播、检索和分析的科学。研究材料和结果是各种各样的生物学数据生物信息学的基本研究方法生物学数据库的建立数据的检索数据的处理数据的利用生物信息学生物学数据库的建立生物学数据库的建立一般由专门的机构来完成。这些机构包括一些国家支持的非盈利性机构和一些知名大学的研究机构。有的实验室为了研究工作的需要也可建立一些小型的数据库。数据库可分为一级数据库和二级数据库,一级数据库的数据直接来源于实验获得的原始数据,只经过简单的归类整理和分析;二级数据库是在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标而建立的。目前,世界著名的三人核心数据库是PDB生物大分子结构数据库、SWISS-PROT蛋白质序列数据库和GenBank核酸序列数据库。生物信息学数据的检索在研究中根据不同的实际需要,检索不同的数据库。如查找DNA序列即选择核酸序列数据库,查找蛋白质序列则选择蛋白质序列数据库等。生物学数据库的检索包括收集和筛选两个方面,根据研究者的实际需要而加以应用。生物信息学无论是实验中产生的数据,还是在数据检索中查得的数据都要经过处理,一般先是对数据进行格式编辑,然后对大量的数据进行分类和整理。为了使用的方便,根据需要也可建立一个自己的小型数据库,以便于使用。数据的处理生物信息学