文档介绍：藻类基因组学研究进展藻类是最简单的植物,结构简单,无根、茎、叶分化,一般都具有进行光合作用的色素,属于自养植物。藻类包含原核的蓝藻如原绿藻,真核的红藻、绿藻、褐藻等。藻类植物跨越了原核和真核两界,对于了解生物起源、演化及机制意义重大,是生物学家共同关注的热点之一。,建立完整的遗传信息数据库,只有研究生物的基因组,,SSR等分子标记促进绘制高精度遗传图谱DNA测序技术和计算机序列分析随着分子生物技术的发展,越来越多的物种包括藻类被不同程度地测序:基因组测序和EST;建立了基因文库中心(GenBank)贮存、分析、处理各种生物的DNA序列、遗传图谱完成测序的藻红藻(Cyanidioschyzonmerolae);集胞藻();鱼腥藻();聚球藻();嗜热聚球藻(uselongatesBP-1);胶菌藻(7421);原绿藻(usmarinusMED4;;;-1)绿藻(莱茵衣藻Chlamydomonasreinhardtii)、强壮团藻Volvoxcarteri、古老的,最小的藻(ustauri、uslucimarinus)小球藻ChlorellaNC64A。硅藻(海链藻Thalassiosirapseudonana;三角褐指藻Phaeodactylumtricornutum)。基因组测序正在进行基因组测序,包括Alexandriumtamarense;Amphidiniumoperculatum;usanophagefferens;Chlorellavulgaris等藻。在藻类中除了基因组序列之外,还有大量的表达序列标签(EST)已被测序,这些序列可从NCBI网站EST数据库获得。EST数据来自硅藻、绿藻、红藻、褐藻、金藻和腰鞭毛虫,这些EST序列为全长cDNA的获得奠定了基础。基因组核基因组线粒体基因组质体基因组Kuck首次测序了斜生栅列藻()线粒体全基因组序列(NC_002254)。Burger等测定了Porphyrapurpurea的线粒体全序列,环形排列的36753个碱基对中包含了57个紧密排列的基因。Leblanc结合红藻线粒体数据分析了线粒体基因组,认为线粒体从十亿年前到现在结构和功能发生了很大的变化,植物线粒体庞大且有重排趋势,真菌、动物则有减少趋势。线粒体基因组质体是植物细胞中的光合细胞器,在高等植物及绿藻中称为叶绿体。基因组一般都是闭合环状的DNA分子,藻类质体基因组大小在73~400kb之间,比高等植物的大。已建立了20多种藻类质体基因组的物理图谱与部分基因图谱,有18种已被完全测序。质基因组Glockner于2000年测序分析了单细胞红藻高温红藻(Cyanidiumcaldarium)的叶绿体基因,发现了一些特殊的结构特征,例如非遗传信息区域的发夹结构,没有大的重复单元,并且认为这种叶绿体基因组的结构是最原始的。莱茵衣藻(Chlamydomonasreinhardttii)是一种单细胞真核绿藻,只含有一个叶绿体,是研究光合作用过程的很好的模型。Asamizu等从光合自养生长的单细胞莱茵衣藻的均一化、大片段cDNA文库中筛选了11571个5’端ESTCrepineau等分别从掌状海带(Laminariadigitata)配子体和孢子体的cDNA文库中选取了大约500条序列进行EST分析。在配子体的412个EST中有39%与已知序列相似,而孢子体的493个中有48%的相似。Nikaido等从条斑紫菜配子体的cDNA文库中建立了10154条EST,%的序列与已知序列有相似性,%的EST是首次报道的新序列。藻类的EST研究