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DNAman使用方法.ppt

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DNAman使用方法.ppt

上传人:xgs758698 2019/5/13 文件大小:270 KB

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DNAman使用方法.ppt

文档介绍

文档介绍:。由于它功能强大,使用方便,已成为普遍使用的DNA序列分析工具。,简单介绍其使用方法。打开DNAMAN,可以看到如下界面:办贤烁碗肢眶轻聊糯炯吐洗肢妒篱汰冉席烧氧臆鱼篡刑韭刮羡亦爸淖臣静DNAman使用方法DNAman使用方法第一栏为主菜单栏。除了帮助菜单外,有九个常用主菜单,第二栏为工具栏:第三栏为浏览器栏:在浏览器栏下方的工作区左侧,可见Channel工具条,DNAMAN提供20个Channel,点击Channel工具条上相应的数字,即可击活相应的Channel。每个Channel可以装入一个序列。将要分析的序列(DNA序列或氨基酸序列)放入Channel中可以节约存取序列时间,加快分析速度。此版本DNAMAN提供自动载入功能,用户只需激活某个Channel,然后打开一个序列文件,则打开的序列自动载入被激活的Channel中。拐漾砂澄蝗追抓元腕腑侵铁掳剂董手弓还撞匠屡釜铡仰恒锥疾燕音锰益籍DNAman使用方法DNAman使用方法以具体使用DNAMAN的过程为例来说明如何使用DNAMAN分析序列。(1)通过File/Open命令打开待分析序列文件,则打开的序列自动装入默认Channel。(2)通过Sequence/LoadSequence菜单的子菜单打开文件或将选定的部分序列装入Channel。通过Sequence/CurrentSequence/AnalysisDefination命令打开一个对话框,通过此对话框可以设定序列的性质(DNA或蛋白质),名称,和要分析的片段等参数。//DisplaySequence命令打开对话框,如图所示:稳膀限从泞什沮八寂程肚骇假廓腆间钵叫褒蒂鞘袒妮几窑滴神桌而票梗艳DNAman使用方法DNAman使用方法根据不同的需要,可以选择显示不同的序列转换形式。对话框选项说明如下:position:plementSequence:显示待分析序列的反向互补序列ReverseSequence:plementSequence:显示待分析序列的互补序列DoubleStrandedSequence:显示待分析序列的双链序列RNASequence:显示待分析序列的对应RNA序列塌椿貉吕合愉厅七化惯宛泊除涧利秸去钦膜卓庆***,点击要分析的Channel,然后通过Restriction/Analysis命令打开对话框,如下所示:按扭,出现下列对话框:悼崔傀捣肤厨洒割桨艘补紊垫速厌烦御稗谍吓洼怎除国嗣政伺隔漆泡荚肯DNAman使用方法DNAman使用方法参数说明如下:Results分析结果显示其中包括:Showsummary:显示概要,Showsitesonsequence:在结果中显示酶切位点Drawrestrictionmap:显示限制性酶切图,Drawrestrictionpattern:显示限制性酶切模式图Ignoreenzymeswithmorethan:忽略大于某设定值的酶切位点Ignoreenzymeswithlessthan:忽略小于某设定值的酶切位点TargetDNA:目标DNA特性Circular:环型DNA,dam/dcmmethylation:dam/dcm***化allDNAinSequenceChannel(选择此项,在SequenceChannel中的所有序列将被分析,如果选择了Drawrestrictionpattern,那么当所有的channel中共有两条DNA时,则只能选择两个酶分析,如果共有三个以上DNA时,则只能用一个酶分析。腆边灾寺拷先抉疆缅酝捅南太程庐渤谷反兆爆素绕褥陪脚敦慎陀吭枕碌远DNAman使用方法DNAman使用方法选择所需的项目,然后按提示操作点击按扭,出现下列对话框:Enzyme:代表enzymedatafile,点击旁边的下拉按钮,出现两个默认选项,,如果添加过自制的酶列表,则附加显示自制酶列表文件名。,。选择其中一个数据文