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葡萄糖激酶基因启动子-30位点PCR扩增的实验条件研究.docx

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葡萄糖激酶基因启动子-30位点PCR扩增的实验条件研究.docx

上传人:小博士 2019/5/15 文件大小:56 KB

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文档介绍

文档介绍:葡萄糖激酶基因启动子一30位点PCR扩增的实验条件研究卫俊杰1刘华2(通讯作者)苏艳丹2陈瑞春2(1云南省中医院检验科云南昆明650032;2昆明医学院第一附属医院检验科云南昆明650011)【【文献标识码】A【文章编号]1672-5085(2010)28-0204-02【摘要】为确定PCR(聚合酶链反应)扩增葡萄糖激酶基因启动子区,对影响PCR的实验因素进行了系统研究。研究结果表明:μmol/L;以1U酶量效果最满意;最适dNTP浓度为167μmol/L;最适Mg2+。【关键词】聚合酶链反应基因扩增条件聚合酶链反应(PCR)的开发是用来分析基因失调、恶性疾病和许多感染性疾病。为了避免由于不适合的反应条件导致的错误结果,在一种方法应用于临床常规实验之前要对影响反应结果的因素进行研究。木文就从白细胞中提取的基因组DNA作为模板,研究了应用PCR方法扩增葡萄糖激酶基因的最适实验条件,以便进而研究其与2型糖尿病发生的关系。现以正常人的基因为对象,报告如下。:PE9600基因扩增仪;BIO-RADPowerPac3000型电泳仪;Mini-PROTEINII型电泳槽及GelDoc1000紫外图像分析系统;TJ-6型低温离心机;430pH计;plO,plOO微量加样器。主要试剂:5OD260的寡核昔酸引物;100mmol/L的dNTP;低熔点琼脂糖;5U/μl的Taq酶。:木文使用的模板是从人体白细胞中应用酚/***仿/异戊醇提取的基因组DNA[l]o提取的模板用100μITE缓冲液,60°C加热10-15分钟溶解后,・20°C冰冻保存。目的片段的扩增:寡核昔酸引物根据文献报道设计:上游引物为5’-ATG-3’,下游引物为5’--3’,扩增片段长度为258个碱基。反应体系中模板lμl,10×缓冲液3μl,加双蒸水至30μl条件不变,分别变化Taq酶、dNTP、引物、Mg2+的浓度,按94°C预变性5min,后94°Clmin,60°Clmin,72°Clmin进行35个循环,最后72°C延伸5min<>用2%琼脂糖凝胶电泳,透射式紫外灯下观察扩增产物片段。-〜5U之间。结果表明,均可以扩增出目的DNA,产物量之间并无差异,但5U时出现非特异性扩增。为了使以后扩增更加有效,选择Taq酶量为1U。μmol/L。高浓度的引物可能会引起反应的错配或非特异性产物。其他扩增条件不变的情况下设定系列引物浓度,范围设计在04〜lμmol/L的浓度之间。结果表明,均有产物扩出,引物二聚体的浓度依次增加,μmol/L吋产物量接近最高而二聚体的浓度相对低;当到达1μmol/L吋二聚体明显过剩,产物量反而降低;μmol/L为最佳浓度。-般反应中每种dNTP的最终浓度可为