文档介绍：注:
1、带“★”表示1小时以上的特别篇,带“◆”表示动画原创,即漫画原作中没有的,B表示出现黑衣组织,F表示出现FBI,C表示出现CIA,S表示出现工藤新一,X表示出现服部平次,K表示出现怪盗基德。
2、电视上播放的动画顺序与DVD版的收录顺序并不一致,该列表以电视播放顺序为准[2]。
3、爱奇艺网将柯南国语版动画中的特别篇进行了拆分,因此其目录与日语版有差异。动画目录以日语版为准。
4、2011年8月~2012年8月间播出的《华丽的对手们》《红色之泪的秘密》等以基德(快斗)为主要人物的7集动画,改编自青山刚昌的另一部漫画作品《魔术快斗》,以柯南特别篇形式播出,可以算作《魔术快斗》动画版第2~8集,日本官方未将其算在《名侦探柯南》动画目录中[2-3],但绝大部分视频网站都将其作为柯南正式动画而续接下去。(详见“《魔术快斗》相关特辑”)
1996年(1-42)
  1 云霄飞车***事件 B/S
2 董事长千金绑架事件
3 偶像密室***事件
4 大都会暗号地图事件
5 新干线大爆破事件
6 情人节***事件◆
7 每月一件礼物威胁事件
8 美术馆***事件
9 天下第一夜祭***事件
10 足球选手恐吓事件
11 钢琴奏鸣曲《月光》***事件★
12 步美被绑架事件
13 奇怪的寻亲***事件
14 谜样的讯息狙击事件◆
15 消失的尸体***事件
16 古董收藏家***事件
17 百货公司挟持事件◆
18 六月新娘***事件
19 电梯***事件◆
20 鬼屋***事件
21 电视台外景队***事件◆
22 豪华客轮连续***事件(前篇)
23 豪华客轮连续***事件(后篇)
24 丧失记忆的美女事件◆
25 真假人质绑票事件◆
26 爱犬约翰***事件◆
27 小五郎同学会***事件(前篇)
28 小五郎同学会***事件(后篇)
29 计算机***事件◆
30 不在场证明***事件◆
31 电视台***事件
32 咖啡厅***事件
33 侦探团生还事件◆
34 山庄绷带怪人***事件(前篇)
35 山庄绷带怪人***事件(后篇)
36 星期一晚上7:30***事件◆
37 仙人掌花***事件◆
38 赤鬼村火祭***事件
39 企业家千金***事件(前篇)
40 企业家千金***事件(后篇)
41 优胜锦旗被割事件◆
42 卡拉OK厅***事件
1997年(43-85)
  43 江户川柯南诱拐事件
44 堀田三兄弟***事件◆
45 敷面膜***事件◆
46 雪山山庄***事件
47 健身俱乐部***事件◆
48 外交官***事件(前篇) X
49 外交官***事件(后篇) X/S
50 图书馆***事件
51 高尔夫练****场***事件◆
52 雾天狗传说***事件★
53 神秘凶器***事件◆
54 电玩公司***事件 B
55 列车手法***事件◆
56 清洁车***事件◆
57 福尔摩斯迷***事件(前篇) X
58 福尔摩斯迷***事件(后篇) X
59 首次跑腿***事件◆
60 插画画家***事件
61 幽灵船***事件(前篇)◆
62 幽灵船***事件(后篇)◆
63 大怪兽哥梅拉***事件
64 第三个指纹***事件◆
65 螃蟹和鲸鱼绑架事件◆
66 夜路***事件◆
67 舞台女演员***事件◆
68 暗夜男爵***事件(事件篇)
69 暗夜男爵***事件(疑惑篇)
70 暗夜男爵***事件(解决篇)
71 米花之狼***事件◆
72 三胞胎别墅***事件
73 少年侦探队遇难事件◆
74 死神阵内***事件◆
75 金融公司社长***事件
76 柯南VS怪盗基德★ K
77 名门连续惨死事件(前篇) X
78 名门连续惨死事件(后篇) X
79 银行强盗***事件◆
80 流浪画家***事件◆
81 当红歌星绑架事件(前篇)
82 当红歌星绑架事件(后篇)
83 综合医院***事件◆
84 滑雪别墅***事件(前篇)
85 滑雪别墅***事件(后篇)
1998年(86-128)
  86 诱拐现场特定事件◆(该集根据漫画《名侦探柯南特别篇》改编,并非青山刚昌的原作)
87 白鹤报恩***事件◆
88 德休拉别墅***事件(前篇)◆
89 德休拉别墅***事件(后篇)◆
90 花香***事件◆
91 抢匪住院事件
92 恐怖登山***事件(前篇)◆
93 恐怖登山***事件(后篇)◆
94 雪女传说***事件◆
95 小五郎约会***事件◆
96 走投无