搜索过渡态.ppt

文档介绍：搜索过渡态反应物反应的第一过度态反应的第二过度态反应活性中间体反应产物Br2和丙烯加成反应的反应能量进程图。反应物过度态?(111)表面,先导入Pd晶体结构。从菜单栏中选择File|Import。在structures/metals/pure-,按Import。现在更改此结构的显示方式。,选中DisplayStyle。从Atom标签的显示方式列表中选择BallandStick。关闭对话框。MaterialsVisualizer中的CleaveSurface工具允许我们劈开任一个大块晶体的表面。从菜单栏中选择Build|Surfaces|CleaveSurface。CleaveSurface的对话框如下。把Cleaveplane中的米勒指数从(-100)改为(111)。。按下Cleave按钮。选择SurfaceMesh标签,-,然后按下TAB键。-1,然后按下TAB键。关闭对话框。于是打开了一个包含2D周期性表面的新的3D模型文档。尽管如此,CASTEP需要一个作为输入的3D周期性体系。我们可以使用VacuumSlab工具获得它。从菜单栏中选择Build|Crystals|BuildVacuumSlab,。按下Build按钮。此结构从二唯周期性变成三唯周期性结构,在原子上添加了一层真空。我们可以移去单胞底部的对称性图形,对称性图形同时也出现在晶胞的上部。