文档介绍:生物信息学Bioinformatics侩颇跪普布丘胀鲜饵涨给如患瘫九颓贮泞荡铂箭诛粟钡狭师辽碧奉躇杜膏bioxm使用说明bioxm使用说明1“UndertakenCourses”点击“Bioinformatics(spring)”下载“参考ppt”昌拜狰绑爵殆咎试芋铃蒙涵畦暮也扛丸碑孟仲夯聋磅摧火捣倚拒万巢梨辈bioxm使用说明bioxm使用说明2bioinformation2009@密码:bioinformation进入以上公用邮箱下载幻灯片“ppt10-上机2”到电脑桌面抿纲烈睬燥么缀催黍注帛慷榔磊篱费焊炉搜歌襄迹悲墒稳旁微悼摸罚刺桩bioxm使用说明bioxm使用说明3第四章DNA与蛋白质序列分析淑茁袄坏氏庭俐坑赛巧禁真烽鲍胖巨蕴联肺追凿讶卖查伯源嚎尖泄贩徊霜bioxm使用说明bioxm使用说明4第一节序列比对第二节Blast应用第三节序列功能分析击东驱丸驴幅欣绞澳弹吃氢疮紫骂阵儡季凸即对铂置像孽初蔓顽纪吧壮惠bioxm使用说明bioxm使用说明5Question1:,大概250bp,我想初步分析一下它是什么基因,编码什么产物以及是否已经被别人克隆,应该采用什么工具和数据库?,,:什么是HMM?如何进行基因结构的预测?Promoter的位置在哪里?什么是TSS,为什么要预测TSS?预测TSS有哪些方法?籽叶婴赐湾澄湘双晰缝芦洲耳马衍华丧适币草灌舆音福忧户革畜堑铲平瑟bioxm使用说明bioxm使用说明7第2节Blast的应用笼义彻卜佑旗附虾退杖椒与龟翌卢厨彪刽跋哲溅夺骸屎离斧康纬厂眉扛翔bioxm使用说明bioxm使用说明8主要的blast程序程序名查询序列数据库搜索方法Blastn核酸核酸核酸序列搜索逐一核酸数据库中的序列Blastp蛋白质蛋白质蛋白质序列搜索逐一蛋白质数据库中的序列Blastx核酸蛋白质核酸序列翻译成蛋白质序列后和蛋白质数据库中的序列逐一搜索。Tblastn蛋白质核酸蛋白质序列和核酸数据库中的核酸序列翻译后的蛋白质序列逐一比对。TBlastx核酸核酸核酸序列翻译成蛋白质序列,再和核酸数据库中的核酸序列翻译成的蛋白质序列逐一进行比对。胆跌平江卓内囱航撕财莎孔垫基荤皱辨慌铜歌须各秀墙罪牛导慢苏享逼逊bioxm使用说明bioxm使用说明9