文档介绍：什么叫单细胞基因测序(SingleCellSequencing)?一句话说,就是单个细胞水平上对基因组进行测序。2013年,Nature杂志把年度技术授予了单细胞基因测序(SingleCellSequencing),认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。单细胞基因组、转录组分析单细胞测序通过对单个细胞进行基因组扩增和测序解决了用组织样本无法获得不同单个细胞的异质性信息、样本量太少无法进行常规测序的难题研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向为早期检测、诊断疾病及疾病的个体化治疗提供指导。基因组及转录组分析中常遇到的难题:全基因组和全转录组分析的难题:单细胞测序应用领域单细胞全基因组测序:1、体外受精的胚胎测序:在把胚胎植回母体之前,先取一个细胞进行测序,确认基因正常后再植回,以保障胚胎是正常的。2、CTC细胞测序:通过对血液中的肿瘤细胞测序,找到突变位点,针对性能进行靶向药物治疗。3、肿瘤亚细胞群测序:肿瘤发生、发展中,细胞不断发生新的突变,形成许多亚细胞群,单细胞测序可以对这些亚细胞群进行分别的测序,并找到对应的治疗方案。4、免疫测序:免疫细胞在对抗原发生识别后,免疫细胞的基因组发生重排,并产生对抗原特异的抗体。对免疫细胞的测序,可以找出特异的基因结构。5Title,Location,Date一、Research的一项分析报告指出,2014年全球单细胞分析(Single-cellAnalysis),,复合增长率达21%。根据GENReports的报告,关于单细胞分析的文章发表在过去的几年也有着爆发性的增长。图2:单细胞分析的文章发表数量二、单细胞基因测序的基本流程:单细胞分离--基因组扩增--测序和分析单细胞测序,主要经过如下的步骤:单细胞的分离DNA/RNA的提取和扩增(全基因组扩增和全转录组扩增) 单细胞的捕捉和分离单细胞测序的第一步是单细胞的分离和提取,目前的方法主要有:,etalCANCERDISCOVERYJUNE2014单细胞操作的仪器FluidigmC1单细胞操作毛细管显微操作单细胞10XGenomicsIllumina与Bio-Rad发布Singel-CellSequencingSolutionQIAscout武汉友芝友-CTC捕获仪强生-CellReserch10Title,Location,Date