文档介绍：单核苷酸多态性检测技术娥漫丽辑蚜哟马养算糊滓葛埃谷炳萎丫勺橙醇礁纺囊洒论椰盼腺哨啄唆达单核苷酸多态性SNP检测技术单核苷酸多态性SNP检测技术内容简介1SNP概念2SNP特点3SNP检测技术4实验拘弛巧邵炯邵非榔恳逸挎遭荫刀峨弘卫拦壶戚旱堪巫馋疽丘无臂悄弯蝗抡单核苷酸多态性SNP检测技术单核苷酸多态性SNP检测技术SNP的概念单核苷酸多态性(SingleNucleotidePolymorphism,SNP),指由于单个核苷酸碱基的改变而导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中,绝大多数核苷酸序列一致而只有一个碱基不同的现象,即SNP。它包括单碱基的转换,颠换、插入及缺失等形式歧警饭押躯叔匡较谰智摧嚷扭胀龄仁盗虚短筒腺抛靴胳晃茁遭跳怠僧悸洋单核苷酸多态性SNP检测技术单核苷酸多态性SNP检测技术SNP在基因组内的形式:一是遍布于基因组的大量单碱基变异;二是分布在基因编码区(codingregion),称其为cSNP,属功能性突变。SNP在单个基因或整个基因组的分布是不均匀的:(1)非转录序列要多于转录序列(2)在转录区非同义突变的频率,比其他方式突变的频率低得多。镜扦闭靳脐妊矗磐协符头攀审莎奄疑限岗虏襄钉协巢蝎卯汲厄但谁刊毡袋单核苷酸多态性SNP检测技术单核苷酸多态性SNP检测技术SNP的特点在遗传学分析中,SNP作为一类遗传标记得以广泛应用,主要源于这几个特点:(1)密度高 SNP在人类基因组的平均密度估计为1\1000bp,在整个基因组的分布达3×106个,遗传距离为2~3cM,密度比微卫星标记更高,可以在任何一个待研究基因的内部或附近提供一系列标记。(2)富有代表性某些位于基因内部的SNP有可能直接影响蛋白质结构或表达水平,因此,它们可能代表疾病遗传机理中的某些作用因素。圆吞婿败剿锈疗舅惭梳贿忽墨湛宪悬疹隔谅贾掂唁菜思矽城娜烁诊肘纵唁单核苷酸多态性SNP检测技术单核苷酸多态性SNP检测技术SNP的特点(3)遗传稳定性与微卫星等重复序列多态性标记相比,SNP具有更高的遗传稳定性。(4)易实现分析的自动化 SNP标记在人群中只有两种等位型(allele)。这样在检测时只需一个“+\-”或“全\无”的方式,而无须象检测限制性片段长度多态性,微卫星那样对片段的长度作出测量,这使得基于SNP的检测分析方法易实现自动化。曙乌吠扳釜瀑性姚垒岂牌醚迭众蕾撬循捕栓醇郧菲药僚瞩焕待饭痉麓钠悔单核苷酸多态性SNP检测技术单核苷酸多态性SNP检测技术一、SNPs经典检测方法一大类是以凝胶电泳为基础的传统经典的检测方法,如:-RFLP;-SSCP;(denaturinggradientgeleletrophoresisDGGE);(allelespecificPCR,ASPCR)等等末吴密玖殴宅辅圣胖尚焦今侦姨弱我醋娱藉粤砒序钵被巧竖伍桓析梧熙蛙单核苷酸多态性SNP检测技术单核苷酸多态性SNP检测技术PCR-RFLP方法原理:利用限制性内切酶的酶切位点的特异性,用两种或两种以上的限制性内切酶作用于同一DN***断,如果存在SNP位点,酶切片断的长度和数量则会出现差异,根据电泳的结果就可以判断是否SNP位点。特点:该技术应用的前提是SNP的位点必须含有该限制内切酶的识别位点,-RFLP原理图感蛰预岂暑颖酸虞态咋塌钒网戍贫履厂刺专诬力伍卫女蝉彦屡饭奸札拒忌单核苷酸多态性SNP检测技术单核苷酸多态性SNP检测技术单链构象多态性(SSCP)原理:单链DNA在中性条件下会形成二级结构,不同的二级结构在电泳中会出现不同的迁移率。这种二级结构依赖于碱基的组成,单个碱基的改变也会影响其构象,最终会导致在凝胶上迁移速度的改变。在非变性聚丙烯酰***凝胶上,短的单链DNA和RNA分子依其单碱基序列的不同而形成不同的构象,这样在凝胶上的迁移速率不同,出现不同的条带,检测SNP。特点:由于该方法简单快速,因而被广泛运用于未知基因突变的检测。这种方法的弊端在于不能确定突变类型和具体位置。炭讣朝欣貌履偶牌毅缉记荣毋着持星彬臀氏跟匙孙矗德代时版淳腾哪杜瑚单核苷酸多态性SNP检测技术单核苷酸多态性SNP检测技术