蛋白质分析和蛋白质组学.ppt

文档介绍：第十章、蛋白质分析和蛋白质组学proteinRNADNA1医学下载吧ein[4]Proteinfunction[3]ProteinlocalizationGeneontology(GO):--ponent--biologicalprocess--molecularfunction[1]Molecularbiology[2]Proteinfamilies2医学下载吧4的介绍:GeneOntology(GO)Consortium3医学下载吧Ontology成立的背景Year19822005Numberofrecords60244,202,133GenBankEMBLDDBJPubMed:over15millioncitations4医学下载吧’sinaname?ponents5医学下载吧’sinaname?parisonisdifficult–inparticularacrossspeciesoracrossdatabases6医学下载吧(ontology)计算机科学对自然世界认知的形式化的表示,既是可被计算机表示,解释和利用的知识的形式化的研究—即本体。本体是结构化的领域知识,并可以被计算机解释和利用。实现对生命世界中这些概念理解上的共享,包括从不同的视角,不同的术语分类,不同的主体(人和机器)共享概念--概念化的规范GeneOntology(GO)协会致力于这样一项工程:编辑一组动态的而又可控的词汇来描述基因和基因产物(主要是蛋白质)不同方面的性质。7医学下载吧logiescanberepresentedasgraphs,wherethenodesareconnectedbyedgesNodes=conceptsintheontologyEdges=relationshipsbetweentheconceptsnodenodenodeedgeOntologyStructure8医学下载吧蛋白质能做什么?“功能”太有局限性。生物学家想知道:每个蛋白质能做什么,属于哪条细胞回路或者为什么细胞需要这个功能,以及在什么地方发生了这样的过程。9医学下载吧Ontology的发起芽殖酵母基因组数据库(SGD)果蝇基因组数据库(drosophilagenomedatabase,简称FlyBase)小鼠基因组信息数据库;(mousegenomeinformationdatabase,简称MGD/GXD)GO数据库不是以其自身为中心而是依靠外部数据库,这些外部数据库中收录的基因及其产物都将用GO定义的词汇进行注释。因此GO是与时俱进与相互合作的代表,它致力于统一基因及其产物注释的方式。YoucanvisitGOat学下载吧