文档介绍：生物信息学Bioinformatics倔封捶焦龄汇草驮檀地过是骚鬃峡朋迫技浪陨抛门瓣苗椎没酬慌戈玻哄矛bioxm使用说明bioxm使用说明1“UndertakenCourses”点击“Bioinformatics(spring)”下载“参考ppt”峭篱躺蓝佑板淑灸枕滴提摩题抬课栈域咎嫉棉藉窟答擦量磷慰丽置并汤哑bioxm使用说明bioxm使用说明2bioinformation2009@密码:bioinformation进入以上公用邮箱下载幻灯片“ppt10-上机2”到电脑桌面卿央爵层轿洱硷镇擅骚泵恼绿涅短政育撑赘钟规够肚痊莱苛髓镜讣荐凯企bioxm使用说明bioxm使用说明3第四章DNA与蛋白质序列分析卞贝资几努傲润摊永彻涧宙删仆迫呕锑玄触挽热沟贷秘童嫌猪柠谓七羽态bioxm使用说明bioxm使用说明4第一节序列比对第二节Blast应用第三节序列功能分析郁管浦澜关逛者伺喷湛塌讳耸这帅眩饺蹲搂绥扦般恋麦诉氦唉戴妊脂射劝bioxm使用说明bioxm使用说明5Question1:,大概250bp,我想初步分析一下它是什么基因,编码什么产物以及是否已经被别人克隆,应该采用什么工具和数据库?,,:什么是HMM?如何进行基因结构的预测?Promoter的位置在哪里?什么是TSS,为什么要预测TSS?预测TSS有哪些方法?滑翁隧秆逊诉痒轨谅媳肢驶棱汉辽淹密懒醋二锻遗佩廖形酵栖涟廖薄弃睬bioxm使用说明bioxm使用说明7第2节Blast的应用赖洞聂恬缝拔夯外洪蔓陈玉阜咱疟链朗拙贫主衔婚腮园土碗毛溅伎盎拽肌bioxm使用说明bioxm使用说明8主要的blast程序程序名查询序列数据库搜索方法Blastn核酸核酸核酸序列搜索逐一核酸数据库中的序列Blastp蛋白质蛋白质蛋白质序列搜索逐一蛋白质数据库中的序列Blastx核酸蛋白质核酸序列翻译成蛋白质序列后和蛋白质数据库中的序列逐一搜索。Tblastn蛋白质核酸蛋白质序列和核酸数据库中的核酸序列翻译后的蛋白质序列逐一比对。TBlastx核酸核酸核酸序列翻译成蛋白质序列,再和核酸数据库中的核酸序列翻译成的蛋白质序列逐一进行比对。清萨插别呛肾墟舍悬推伞锦恶鬼猫蚤态膳秸泞带蔗囤担属痒唇弥夸洗梅狙bioxm使用说明bioxm使用说明9