文档介绍：西北工业大学
硕士学位论文
DNA全序列分形特征研究
姓名:卢颖
申请学位级别:硕士
专业:控制理论与控制工程
指导教师:潘泉
20030201
摘要因功能的讶究逐渐成为耄点。这就需要将生物謦弼作为一个有车咒豹整体,来考察其在系统层次上突现出来的整体特征。本文从全局和鳃节两个角度对全序列的分形特征和自稠似特性进行了研究,以求更全面更准确地反映序列的分黟现象。全蜀豹热寝在二维图上袋示了完熬基因缀序弼的分形特征,并对箕加以分析,发现其分形特征与序列中备碱基串的分布和含量存密不可分的关系。啥訢序列分形特征作进一步研究方面,首先用小波变换和分段平均毽立时频谱法对葵叁榴戗性秘长程襁关·睦进行检验,紧接羞雳肿菔稚熬于小波的间接估计方法对其分形参数即凳辛斯兰坪捅冉戏治觯黢凌在不凌尺度下凳灰恢拢勘鏟骷戆馨攫旗啾7形特征作了进一步研究,把一维小波变换推广维,为二维信号的分彤参数自相似结构。只梅在低频部分才可以用严格自相似信号来描述。1憷笮ぷ鳎芙岢晒杓屏艘桓稣攵訢序列分形特征研究本论文的研究工作可以定性地解释蛄械姆中蜗窒蟆M保谧芙关键阋:分形,自相似,图,小波变换,凳琈进入厩基因缎时代,随着生物信息学的发展和基因组数据的飞速积累,基贒序列的可视化研究中,利用语言学的思想和可视化框图法,从倦计提⒘艘恢纸衔:侠肀2慰肌=岵杀砻鳎珼在全净列尺度上表现出渐进瓣软磐。滚软妹苡巡景觌蓟魃#溲煲欢ūO馓P礻俎贰工作的黧础上提嬲了一蛰新的问题和设怒,希望对今后的生物学研究会肖一定的参考价值。北等妒垦宦畚
琓砸氇。,,州北阂荡笱妒宦瓵.,—瑆甇,,甌,.琣。—琣
州北阂等搜妒垦宦琈,篺,琾瓵,,琀
第一章绪论引言长期以来,入类一妻在不叛媳探索叁赛,以及瑟处的这个变幻莫测、纷繁生物学磷究豹每~点逶步,都霹滋辍大逡菸磊我稻对予叁蹇、霹予这令糖溪壁界的了解,促进相关的物理、化学、数学、系统科学、信息科学和计算机科学等学科静发最,戳及诞进对认谈论、方法论等哲学闻藤静愚考。曾指出¨。骸啊镅钦驹谝磺锌蒲У闹行牡目蒲А窃谡飧龅胤健在一切科举的所肖原则都被包罗避去的领域中,辩学才能真正韵统一起束”。整纪之交,全球。蓬豹傣惠纯滚潮滚滚瑟寒,歪鞋匿大熬力量敬变羲人类享圭会。在这个知识缀济的时代,科举技术日新月异,生命科学成就令人瞩目。因藏,生翕辩学被诀为涛残为毽纪垂然辩学静孩心矗芳缘缺缪Х⒋锞踩遥“生命科举”与包括物理、化学、地学等在内的“物质科学”被并列为自然科攀的两大分支。美国科学信息出舨的科学引支索引惺章剂巳浇绲八千余种学术期列,在影响最大即引用率最高的最重要的魏静列物中,除多领域中的刊物⋯。传统生物学以生物物理和生物化学为主要支柱,对生命物质和能量的研究已达囊稽警深的禚度,丽关于生命信息调控梳理的研究却非常少。从濑纪中约恚孀臘双螺旋结构的提出和蛋白质空间结构的解机,允予生物学,羔命科学硪究的主要内容。理论物理硬究所故郝桶林院士在缝的文章胁绵复杂的物质世界。因此,生物学成为整个自然科学研究的宠儿,自然不吉丽喻。学科综合性刊物英国的和美国的猓ú慷际巧蒲时代开始了,对漶传信息载体蜕δ艿奶逑终叩鞍字实难芯俊3晌州北阂荡笱妒垦宦畚箱一章绪论
》杂志上掇邀。鼹年,美麓笺溪说:“懒纪的数理科学对无生命物质的结构和遮动的研究,从微观到宇观,象。”九十年代初堪称与曼哈顿工程和人类登月计划并列的“人类然因组计划”,撂志着天类对卖毽遥求煞燕煮,自藩生命嵇学转商生命辩学。它是疆优生物学转向信息生物学的飘程碑随着人类基因组计划在世界范围内的开展,破译人类及多种模式,圭物的遗传密码已成为生物学领域的重要谦题,同时产生了巨量的基因组信息。如此巨大且具有高度复杂性的生物数据,呼唤羞多静学科的共同努力,来有效地管理和分析这些信息。位于罗克维尔的基因组研究学会的甋稹,生甥学家仅奏一技笔、~张纸裁霹潋黠大部分数据进行分析的时代一去不复返了。他激,对于今天的生物学家们来晚,哪怕魁分子海洋中最冁显豹翁惑,瞧器要依靠诗算梳豹力蚕柬获褥。随着分子生物学、核酸测序技术及蒸因工程的进展,人类越来越强烈地意识翻了解自身的熬要性和必要性,进而提出了“入类基闲组计划”。它最早是年掠蒘加州大学校长谝淮位嵋樯咸岢銎牵这期问,又得到美国能源部卫生与环境研究室前主任瓺年又出美阑科学袈部丌始此课题⒔⒘巳死嗥煲蜃檠芯恐行摹昝拦剂⑽郎芯掰≥建立了人类基嚣缀诗鲻疆究办公室。现京,美国已有个人类鏊函组胃谬囊深量远。,圭余物凄秘生会现象正套戏为篷纪数理科学毳驿究豹蘩要对于是,生物信息学应运丽生。琀的关注。研究中心。年,人类基因组计划诈式启动佴。皁。K侨死嗳鲜蹲陨恚蹦此业火学硕士学位论文第一章绪论
序任务”,即湃旧屙氡圩訢标志至端粒卧千月个碱的德谵⋯。这一体大成裁标志