文档介绍：提到遗传,我们都已经****惯于这样的概念,即基因组的编码信息存在于ACGT这四种碱基的排列顺序中。然而,诸如胞嘧啶的***化修饰及其分布,组蛋白的乙酰化等,同样影响着表型。这就构成了表观遗传学(ics)的主要研究内容。其实,早在1942年,,他指出,表观遗传与遗传相对,主要研究基因型和表型的关系。而现在,对于表观遗传学,比较统一的认识是,其研究在没有细胞核DNA序列改变的情况时,基因功能的可逆的可遗传的改变。也就是说,在不改变基因组序列的前提下,通过DNA和组蛋白的修饰等来调控基因表达,其中又以DNA***化(DNAmethylation)最为常见,成为表观遗传学的重要组成部分。随着人类基因组计划的开展,科学家们开始在基因组水平来研究表观遗传学,逐步形成表观基因组学(epigenomics)。表观基因组学就是要在整个基因组水平来研究表观遗传过程以及与这些过程密切相关的特定基因组区域的识别与鉴定。2000年10月,人类表观基因组协会(HumanEpigenomeConsortium)由欧盟赞助,启动了旨在于人类6号染色体MHC区域首先做出DNA的***化图谱的先导计划(PilotProject)。该计划顺利完成,引导启动了2003年的人类表观基因组计划(HumanEpigenomeProject,HEP)。2005年,美国国家卫生院(NIH)下属的国立癌症研究所启动了癌症基因组先导计划。2006年,该所与国立人类基因组研究所一起共同启动癌症基因组计划(CancerGenomeProject)。表观基因组学和DNA***化与癌症的研究成为新的热点。本文将简要介绍DNA***化与CpG岛,癌症与DNA***化,和DNA***化的重要检测方法。DNA***化与CpG岛:在人类表观遗传学研究中,最常见的就是CpG二核苷酸中胞嘧啶的***化修饰。其主要过程是,在CpG***化结合蛋白(Methyl-CpGBindingProteins,MBDs)和DNA***化转移酶(DNAmethyltransferases,DNMTs)的作用下,使CpG二核苷酸5’端的胞嘧啶转变成为5’***胞嘧啶。在正常人类的DNA中,约有3-6%的胞嘧啶被***化。在哺乳动物中,约有50,000,000个CpG二核苷酸,其中70%的被***化。而那些可被***化的CpG二核苷酸并非随机的分布于基因组序列中,相反,在基因组的某些区域中,通常是基因的启动子区域,5’端非翻译区和第一个外显子区,CpG序列密度非常高,超过均值5倍以上,成为鸟嘌呤和胞嘧啶的富集区,称之为CpG岛(CpGIslands,CGIs)。CpG岛的概念最早由AdrianBird提出,他称之为未***化的HapII小片段(HpaIITinyFragment,HTF),更正式的定义是这样的区域,该区域的序列长度至少200个碱基对,GC含量超过50%,CpG比值(观测值/期望值)。CpG比值的计算方法如下:        最近,为了排除那些Alu重复序列,提出了更严格的标准:长度至少500碱基对,GC含量超过55%,。       据估计,哺乳动物基因组中的CpG岛约有4万个。在健康人的基因组中,CpG岛中的CpG位点一般处于非***化状态,而CpG岛外的CpG位点通常是被***化的