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生物信息学基础 Bioinformatis.ppt

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生物信息学基础 Bioinformatis.ppt

上传人:drp539608 2020/5/12 文件大小:2.64 MB

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文档介绍

文档介绍:(HGP)奋斗目标:探索生命的奥妙,揭开生命之谜,实现人类对自身的认识和保护。肿瘤十年计划;脑计划;蛋白质计划;信号传导计划;遗传工程计划>仅靠单一学科,如细胞学、发育学、遗传学、分子生物学等的独自努力,太局限,难。>要知道事物的局部作用机制,须先知道全局。>进行全部基因(即基因组)的研究(HGP)。最终目的是对生命进行系统科学的解码。移坎逞赌磷舶烂扣率荧榨疮灸捍蚊胜彩送馒协委精好忙桓泣姻捻坏锈蝴颧生物信息学基础Bioinformatis生物信息学基础Bioinformatis遗传学偏向于单个基因的研究,HGP是对整个基因组的全部基因,从整体水平考虑基因的存在、基因的结构和功能、基因之间的相互关系等。HGP成为了生命科学领域第一大科学工程。,WhiteR.,MendelsonhmM科学家专业会议;1985年提出人类基因组计划的动议;1986年McKusickV称从整个基因组层次上研究遗传的科学为基因组学;oR“Science”发表文章;1986GilbertW&BergP主持人类基因组计划专家会议;1987年DOE和NIH下拨研究经费;1988年NRC的专家发表mappingandsequencingthehumangenome报告;1988年成立了国家人类基因组研究中心。Watson第一任主任。“肿瘤研究的转折人类基因组的全序列分析”。包括肿瘤在内的一切疾病的发生,都与基因相关。是“零敲碎打”?还是从整体上研究和分析整个人类基因组?他指出,这个世界上发生的一切事情,都与这人类的DNA序列相关。只有弄清人类基因组全部或大部分基因的工作情况,实施其它计划才有可能。这样的工作是任何一个实验室难以单独承担的。经过5年辩论,美国国会通过“人类基因组计划”1990年10月1日启动。计划15年,30亿$。之后英国、法国、德国、日本、中国。:遗传图谱;物理图谱;序列图谱;).‘土地’的分割;“新大陆探险热”;---弄清基因组结构和功能;弄清地球上的地理位置。2).;(研究工作)的步骤1).基因组作图人类基因组DNA序列分布于22条常染色体和2条性染色体,染色体不能直接测序,故HGP的第一阶段的任务是将基因组这一巨大的研究对象进行分解,使成为较容易操作的小的结构区域,这一过程称为作图。作图的类型:i)遗传连锁图;ii)物理图i遗传连锁图,通过计算连锁的遗传标志之间的重组频率,确定它们的相对距离(cM)。遗传图的作出,需要应用多态性标志。80年代中期,标志是限制性酶切片段长度多态性(RFLP);此类标志的数量较少,多态性信息也较低。80年代中期,发展短串联重复序列标志(shorttandemrepeat,STR;ormicrosatellite,MS)。其信息含量优于RFLP。甘滓做艳冻辕芽淮阔床狡瓣枯礼乾枝币痰方歇谱筑恩府照咯褒钻赖读讫菠生物信息学基础Bioinformatis生物信息学基础Bioinformatis1994年,法国和美国科学家共同努力,完成了由RFLP和MS组成的包括5826个标志、。近来,第三代多态性标志,SNP(singlenucleotidepolymorphism)成为一种新型手段,其意义超出遗传图的范围。ii物理图,确定各遗传标志之间的物理距离图谱(bp,orkb,orMb)。物理图包含了二层意义:一是获得分布于整个基因组的序列标签(sequencetaggedsite,STS),每隔一定距离有一个标志;二是