文档介绍：空间结构预测在空间结构预测方面,比较成功的理论方法是同源模型法该方法的依据是:相似序列的蛋白质倾向于折叠成相似的三维空间结构运用同源模型方法可以完成所有蛋白质10-30%的空间结构预测工作第六节生物信息学所用的方法和技术1、数学统计方法2、动态规划方法3、机器学****与模式识别技术4、数据库技术及数据挖掘5、人工神经网络技术6、专家系统7、分子模型化技术8、量子力学和分子力学计算9、生物分子的计算机模拟10、因特网()技术1、数学统计方法生物活动常常以大量、重复的形式出现,既受到内在因素的制约,又受到外界环境的随机干扰。因此概率论和数学统计是现代生物学研究中一种常用的分析方法数据统计、因素分析、多元回归分析是生物学研究必备的工具隐马尔科夫模型(HiddenMarkovModels)在序列分析方面有着重要的应用。与隐马尔科夫模型相关的技术是马尔科夫链(MarkovChain)2、动态规划方法动态规划(DynamicProgramming)是一种解决多阶段决策过程的最优化方法或复杂空间的优化搜索方法动态规划解决问题的基本过程是:将一个问题的全局解分解为局部解,逆序递推求出局部最优解,随着执行过程的推进,“局部”逐渐接近“全局”,最终获得全局最优解3、机器学****与模式识别技术机器学****机器学****是模拟人类的学****过程,以计算机为工具获取知识、积累经验1、遗传算法采用随机搜索方法,具有自适应能力和便于并行计算2、神经网络的理论是基于人脑的结构,其目的是揭示一个系统是如何向环境学****的,这一种方法被称为联接主义。模式识别模式识别是机器学****的一个主要任务。模式是对感兴趣客体定量的或者结构的描述,而模式识别就是利用计算机对客体进行鉴别,将相同或者相似的客体归入同种类别中模式识别主要有两种方法:根据对象的统计特征进行识别,根据对象的结构特征进行识别环境学****知识库执行机器学****系统的基本结构反馈4、数据库技术及数据挖掘数据库技术数据仓库虚拟数据库技术(VirtualDatabase,简称VDB)数据挖掘(datamining)又称作数据库中的知识发现(KnowledgeDiscoveryinDatabase),它是从数据库或数据仓库中发现并提取隐藏在其中的信息的一种新技术,它能自动分析数据,对它们进行归纳性推理和联想,寻找数据间内在的某些关联,从中发掘出潜在的、对信息预测和决策行为起着十分重要作用的模式数据挖掘过程一般分为4个基本步骤:数据选择、数据转换、数据挖掘和结果分析5、人工神经网络技术人工神经网络(work,简称ANN)是通过模拟神经元的特性以及脑的大规模并行结构、信息的分布式和并行处理等机制建立的一种数学模型在生物信息学中,使用得最多的是反向传播神经网络(work,简称BP网)。BP网被认为是稳定性和鲁棒性较强的人工神经网络之一,而且属于有监督学****的网络模型。标准的BP网由三层神经元组成:输入层、隐藏层和输出层输入层隐藏层输出层反向传播神经网络结构示意6、分子模型化技术分子模型化(Molecularmodeling)是利用计算机模拟分子结构、研究分子之间相互作用的一种技术分子模型化是进行分子设计的基础。分子图形学(MolecularGraphics)是进行分子模型化的一项重要技术,正是由于分子图形学和其它计算化学方法(如分子力学、分子动力学)的相互结合,才使得分子模型化方法取得成功