聚类分析 谱系聚类法.doc

文档介绍：§(门,纲,目,科,属,种),其次依近合小为大,,所含样品数类重心:常用4神类间距离最短距离Dpq最长距离 D睥=maxd..⑶类平均距离D/>(/=-npnq沱G,冲2京'eGpjeGq(4)重心距离%=",「是由GpQ合并所得,〃,.=%+与,则有逆推公式最短距离 Dik=min{Di)k,D(/k};最长距离 D,k=max{Dpk,D(]k}⑶类平均距离o’=2如+ pk qknr 七或 D如f+f重心距离D如外0*+ llr L〃矿统一为D;「=,+气叽+眇匕+y\D"晚\.各种类间距离的参数1Ct1UpPY城短距离「1/云1/20-1/2最长距离|1/21/201/2类平均距离1np/nrnJnr00重心距离|flP/⑴〃品〃类,类间距离矩阵%,%0()d・・•du "12 u\nD<0)=I' ? ; 4”,(注此时Dpq=dpq)• • ••_<1 <2 ••- 0_⑵在D(o)的左下角中,选最小的dpq,则将G.={%},G,/={孔}合并为G,,划去p行,q列,计算G,与余下的〃-2类之间距离,(V)与原类间距构成一个新的类间距离矩阵。⑴从。⑴出发,重复上述过程,,合并时距离(距离水平),,分别按4种距离进行谱系聚类分析,(1)最短距离法(method=single和standard)得*6913个H家综合d力的■短飓K法JR类迁程类的数目新聚类集新类中的样品数■••■一■・13个国力的■短庵直法分4类结果国家所■的类所11类的名祢巴两1CL6印度1CL6加拿大2CU谱系图利利斯大大大罗*国国国国本西度非国澳意俄加tt法英中日巴印南美0 12 ;(4),变景聚类主要作用:|,X2,…,X〃各观测了〃次,其值为*仃)=(%提2尸•••,%)',j=\〜P则X⑺与七/)的相似系数易见<1,%.=%.,*,=1,实际上,是将问题转化为P个〃维向量的相似性问题.]*2…MR=「 1"%• • ••♦ • ••"如…) 先作djj=1-%或《)=1一弟,(i,j=l~p),得2) 对。作前述聚类过程.