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基因组信息分析.ppt

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基因组信息分析.ppt

上传人:柯 2020/10/1 文件大小:10.07 MB

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基因组信息分析.ppt

文档介绍

文档介绍:第三章基因组信息分析GenomeBioinformaticsScienceScienceTHEHUMANGENOME主要内容、引言二、人类基因组计划图谱绘制、基因组分析引言◆基因组(genome)在个体水平代表个体所有遗传性状的总和;在细胞水平是一个细胞所有染色体的总和从分子角度认识,基因组代表了一个物种的所有DNA分子的总和◆基因组学(genomiCS)是阐明整个基因组的结构、结构与功能的关系以及基因之间相互作用的科学◆基因组分析的主要任务是确定基因在染色体上的位置,提供遗传信息,并探讨基因与基因之间以及基因与经典遗传学、医学诸多方面之间的联系◆基因组信息学是指有关基因组信息的存储、获取、处理、分配、分析和注释等方面的研究。目前主要是根据基因组作图和测序的资料与数据,应用数学与统计学、计算机科学、遗传学与分子生物学等多种研究手段,综合分析处理基因组图谱、DNA序列和蛋白质序列等信息,阐明这些资料和数据所包含的生物学意义。〓、人类基因组计划(HGP)HGP主要目标是绘制下列图谱:◆遗传图谱(icmap)◆物理图谱(physicalmφp◆转录图谱(transcriptionalmap)◆序列图谱(sequencemap)◆基因图谱(genemap):,绘制基因组的转录本图谱;003年前完成)5分析基因组的功能P计划所从事的张国谱◆(1)遗传图谱遗传图谱(连锁图):指基因或DNA标记在染色体上的相对位置与遗传距离。遗传连锁图是用遗传标志来描述DNA标记在染色体上的相对位置遗传标志基因组中具有遗传多态性的位点,比如使用微卫星microsatellite,Ms)标记核苷酸的多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP标记。>利用人类基因组中的一些特殊位点作为遗传标志而进行的基因组分区。在遗传连锁图谱上,DNA标记间的距离反映了它们共同遗传的频率。遗传连锁图采用遗传学距离(icdistance)作为图距,遗传距离通常由基因或DN***段在染色体交换过程中分离的频率厘摩(M来表示。1厘摩表示每次减数分裂的重组频率为1%。厘摩值越高表明两点之间遗传距离越远,厘摩值越低表示两点间遗传距离越近在人的遗传连锁图谱上,1cM的物理距离大约为106核苷酸对,人类基因组的遗传大小已经确定为3600cM