文档介绍：生物信息学内蒙古科技大学数理与生物工程学院蔡禄BIOINFORMATICS参考书1、生物信息学教程,蔡禄,2006,化学工业出版社2、简明生物信息学教程,钟扬张亮赵琼2001,高等教育出版社3、生物信息基础,孙啸陆祖宏谢建民,清华大学出版社,20044、IntroductiontoBioinformatics,TKAttwoodDJParry-Smith(罗静初等译)(2002)北京大学出版社5、Bioinformatics:Apracticeguidetotheanalysisofgenesandproteins(李衍达孙之荣译)(2000)清华大学出版社6、Biologicalsequenceanalysis-(2002)清华大学出版社(引进版)数理与生物工程学院2020/10/62第1章生物信息学引论综合论与还原论生物并非只是物质的简单堆积,生物体的生长发育是生命信息控制之下的复杂而有序的过程。如果说物理学是研究物质和能量的学科,那么生命科学就是研究生命物质基础上的信息的学科。目前,我们对生命的奥秘还不甚了解,对生命信息的组织、传递和表达还知之甚少。既然这牵涉到信息的组织、传递和表达,我们就可以用信息科学的方法和技术来尝试认识和分析生命信息。§,生物数据的积累速度不断加快。因此,也就对生物数据的科学分析方法和实用分析工具提出了更新、更高的要求。在这个过程中,需要对实验数据进行处理并及时进行理论分析,在此基础上解释实验现象,认识导致实验现象发生的本质,在“整合”、“系统”等全新理念下探索固有的生物学规律,进而了解和掌握生命的物质基础和生命的本质。BIOINFORMATICS数理与生物工程学院2020/10/64最近10余年来,生物科学与技术迅猛发展,生物学及相关数据的积累速度已大大超出了人们的想象。面对生物信息的爆炸性增长,现有的信息收集、储存、处理和分析方法与工具已远远不能满足实际研究的需要,亟待更新。例如,人类基因组计划(humangenomeproject,HGP)在1990年正式启动后,科研人员用10年时间完成了人类基因组的工作草图(包含3×109亿个碱基对,并对30000余个基因进行了注释)越来越多的微生物和其他模式生物()也已完成了全基因组测序工作。BIOINFORMATICS数理与生物工程学院2020/10/,而且对数据处理工作也提出了前所未有的要求。人们已经充分认识到,如果不能及时分析和有效利用这些信息,那么这些耗费巨资所获得的数据也无异于增加了一堆垃圾。BIOINFORMATICS数理与生物工程学院2020/10/67广义的生物信息学是指以核酸蛋白质等生物大分子为主要研究对象,以信息、数理、计算机科学为主要研究手段,以计算机网络为主要研究环境,以计算机软件为主要研究工具,对序列数据进行存储、管理、注释、加工,对各种数据库进行查询、搜索、比较、分析,构建各种类型的专用数据库信息系统,研究开发面向生物学家的新一代计算机软件。、模式识别、动态规划、密码解读、语意解析、信令传递、神经网络、遗传算法以及隐马氏模型等各种方法,对序列、结构数据进行定性和定量分析,从中获取基因编码、基因调控、序列-结构-功能关系等理性知识,阐明细胞、器官和个体的发生、发育、病变、衰亡的基本规律和时空联系,探索生命起源、生物进化、生