微阵列分析导论专题课件.ppt

文档介绍：课程学时安排
学时：50学时
安排：讲课34学时，实验16学时
学分：3分
成绩：考试占70％，实验和出勤占30％
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微阵列分析导论
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DNA Microarray Data analysis－Iiris Hovatta et al. 2005
Iiris Hovatta et al., (2005) DNA microarray Data Analysis, 2nd Edition., CSC; 2005.
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微阵列分析导论
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在许多情况下，生物学问题最终的解决都源于技术上的突破。

——Mark Schena
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微阵列分析导论
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本书共分为十六章，分届于三大部分，第一部分为基础知识，包括概述、微阵列基因芯片制备和检测技术以及统计学基础；第二部分内容是数据处理方法，包括实验设计、图像的获得和数据的前处理、数据的须处理和归一化、差异表达基因分析、芯片数据的可靠性分析、聚类分析和可视化以及微阵列实验中的分类方法；第三部分主要是与数据挖掘和应用相关的内容，包括微阵列技术的标难化、基因芯片数据的基因注释和功能分析、系统生物学及基因调控网络、基因芯片技术的应用——从基因筛选到临床诊断、主要数据分析软件的介绍和展望。
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微阵列分析导论
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芯片打印仪
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微阵列分析导论
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芯片杂交仪
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微阵列分析导论
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芯片扫描仪
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微阵列分析导论
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生物芯片技术简介
每个组织和细胞中包含各种生物大分子，如蛋白质、DNA和RNA，为了解生物大分子与生命现象的关系，需要研究生物中所有不同种类蛋白质和核酸的功能，而传统检测方法一次只能检测一个生物大分子，生物芯片技术提供了高通量检测生物大分子的方法。
生物芯片：把生物活性大分子（如蛋白质和核酸）或细胞等，密集排列在固定的固相载体上，形成微型的检测器件，固相载体通常是硅片、玻片、聚丙烯或尼龙膜等。
①狭义：微阵列芯片，主要包括cDNA微阵列、寡核苷酸微阵列、蛋白质微阵列和小分子化合物微阵列等
②广义：能对生物成分或生物分子进行快速并行处理和分析的厘米见方的固体薄型器件，主要还包括微流体芯片和“芯片实验室”。
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微阵列分析导论
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生物芯片主要特点
微型化
自动化
网络化
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微阵列分析导论
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生物芯片类型
基因芯片gene chip
蛋白质芯片protein chip
组织芯片tissue microarray
微流体芯片和缩微芯片实验室
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微阵列分析导论
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