文档介绍：蛋白质组学技术及其在中药复杂体系研究中的应用

刘璇, 岳庆喜, 果德安*
中国科学院上海药物研究所中药现代化研究中心, 上海 201203
【摘要】系统生物学在中药复杂体系研究中的可行性和合理性已经获得了中药研究者的认可。在后基因组时
代, 蛋白质组学是系统生物学研究的重要组成部分, 蛋白质组学在中药研究中的应用也已经有了一些成功的实例。
作者在近年来部分研究工作的基础上, 对蛋白质组学的主要研究技术及蛋白质组学在中药复杂体系研究中的应用思
路进行了综述和探讨。
【关键词】蛋白质组学; 中药; 生物信息学; 系统生物学
【中图分类号】 R28, TQ93 【文献标识号】 A 【文章编号】1672-3651(2009)04-0260-10
doi: . J.
中药是经过大量、长期中医临床的实践而总结医药创新发展规划纲要(2006-2020 年)》中明确提出
产生的治疗方法, 历经 2 000 多年的临床应用, 中“充分运用中国所具有的中医、西医和中西医结合
药的有效性、实用性和科学性已经毋庸置疑, 中药三支力量共同发展的历史积累和独特经验, 以及现
可以被称为是我国传统文化的宝贵财富。但是, 中代系统科学与复杂科学等理论和方法, 对中医药学
药是典型的复杂物质体系, 其复杂性使对其作用机蕴含的生命科学问题开展广泛深入的研究和探索,
制的研究非常困难。首先, 中药的来源具有多样性, 在丰富和发展中医药理论和方法学体系的同时, 争
其来源以植物药为主, 其次是动物药、矿物药等。取在与中医药科学内涵相关的若干问题上取得突
各种来源的原料药导致中药中化学成分多种多样, 破”。同一时期, 2007 年 7 月 NATURE 杂志一篇专
化合物的多样性又继而导致中药表现出有多个效门谈论中医药的文章里也指出, “中医药要想取得
应器官、多种作用和多个作用靶点。另外, 中药的突破性进展, 必须依靠系统生物学技术”[1]。系统生
临床应用形式多以复方为主, 复方中多味药的配伍物学(Systems Biology)的概念于 1999 年由 Leroy
应用使得中药的研究更为复杂和困难。复方的研究 Hood 提出, 是指对一个生物系统中所有组成成分
中既需要研究各单方中各化学成分的生物活性, 又(基因、mRNA、蛋白质等)的构成及其在特定条件
需要研究各单方之间的配伍规律及其协同作用方下这些组分之间的相互关系的研究, 其认识生物的
式等。因此, 中药复杂体系的作用机制研究中迫切观点是从局部观走向整体观。系统生物学认为生物
需要应用现代科学发展的新技术和新手段, 探索适系统具有“整体、层次、整合、动态”的特点, 生物
合中药研究的新方法和新模式, 才有可能真正揭示机体内存在通过层次之间、网络之间、系统之间的
其药效物质基础和作用机制, 使其“复杂而可知”。整合和联系建立的无数个大小网络, 而不同网络之
中药包括复方的现代化研究一直是中医药界间的信息整合和传递使基因或蛋白质产生出最终
多年来关注的焦点和研究的热点。近年来, 我台是各种组学,
府已经制定了一系列与中药及其复方现代化研究如基因组学、蛋