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实验一--大肠杆菌基因组提取.doc

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实验一--大肠杆菌基因组提取.doc

上传人:992006838 2021/2/23 文件大小:747 KB

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实验一--大肠杆菌基因组提取.doc

文档介绍

文档介绍:在实验开始,首先对实验的一些必须步骤(注:在几乎每一次小实验都会使用到的试验方法)做一定的解释。避免在写实验报告的过程中太过混乱!并且这些过程并不是每一位同学都参与了的,故在本实验报告的开篇写出。
(一)制备1%的琼脂糖凝胶
称取1g琼脂糖,放入锥形瓶中,加入100 mL的1 × TAE缓冲液,在微波炉中加热。完全融化后,取出摇匀。
(二)胶板的制备
1. 用橡皮膏将胶板的两端边缘封闭好。
2. 将胶板放在水平处,放好样品梳子。
3. 将冷却到60℃左右的琼脂糖凝胶缓慢倒入胶板中,注意不要产生气泡。胶的厚度在3-5mm之间。
4. 待胶凝固后,取出梳子,取下橡皮膏,放入电泳槽内(注意:梳子的方向靠近负极)。
5. 向电泳槽中加入1 × TAE缓冲液,缓冲液要浸没凝胶。
(三)加样
1. 在样品中加入适量的10 ×上样缓冲液,使缓冲液的终浓度为1×。
2. 用微量移液器将已加入缓冲液的样品加入上样孔中。记录加样的顺序和加样量。(注意:加样的过程中不要让样品溢出上样孔)
(四)电泳
1. 接通电泳槽与电泳仪的电源(注意DN***段是从负极向正极移动)。DNA的迁移速度与电压成正比。最高电压不超过5V/cm。
2. 当溴酚蓝染料移动到凝胶的2/3处时,停止电泳。
(五)染色
将电泳后的凝胶浸入溴化乙锭染色液中(带手套操作)。
(六)观察实验结果
在紫外灯(360 nm或254 nm)下观察染色后的凝胶,DNA处显出橘红色的荧光条带。
实验一 大肠杆菌基因组提取
【实验目的】

【实验原理】
DNA是一个环形的大分子DNA,真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内。不同种属的生物,以及不同形式的细胞(如菌类、培养细胞、植物组织,动物组织)基因组提取的方法是不同的,但其基本原则是类似的,即既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含十二烷基硫酸钠(SDS)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质,再用酚和***仿/异戊醇抽提分离蛋白质,得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。SDS的作用机理是由于其能结合蛋白,中和蛋白的电性,使蛋白质的非共价键受到破坏,失去二级结构,从而变形失活,蛋白酶K的重要特性是能在SDS和EDTA(乙二***四乙酸二钠)存在的情况下保持很高的活性。在匀浆后提取DNA的反应体系中,SDS可通过失活蛋白破坏细胞膜、核膜,并使组织蛋白与DNA分离;而蛋白酶K可将蛋白质降解成小肽或氨基酸,使DNA分子完整地分离出来。CTAB(十六烷基三乙基溴化铵)是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(( mol/L NaCl)是可溶的,当降低溶液盐浓度到一定程度( mol/L NaCl)时,从溶液中沉淀,通过离心就可将CTAB-核酸的复合物与蛋白,多糖类物质分开。最后通过乙醇或异丙醇沉淀DNA,而CTAB溶于乙醇或异丙醇而除去。
【实验材料】
大肠杆菌DH5α菌液
【实验试剂】
LB液体培养基,TE溶液,10%SDS,蛋白酶K,5mol/L NaCl, CTAB/NaCl溶液,酚/***仿/异戊醇,异丙醇,70%乙醇
【实验仪器与用具】
微量移液器,低温离心机,水浴锅,eppendorf管,恒温摇床
【实验步骤】
(1)将2mL培养至对数期的大肠杆菌DH5α菌液5000rpm冷冻离心10min弃上清;
(2)加190μL TE悬浮沉淀,并加10μL 10%SDS,1μL 20mg/mL蛋白酶K,混匀,37℃保温1h;
(3)加30μL 5mol/L NaCl,混匀;
(4)加30μL CTAB/NaCl溶液,混匀,65℃保温20min;
(5)加入300μL酚/***仿/异戊醇(25:24:1)抽提,5000rpm离心10min,将上清液移至干净离心管;
(6)加入300μL***仿/异戊醇(24:1)抽提,取上清液移至干净管中;
(7)加300μL异丙醇,颠倒混合,室温下静止10min,沉淀DNA;
(8)5000rpm离心10min,沉淀DNA,加入500μL70%乙醇,5000rpm离心10min,弃乙醇,吸干;
(9)溶解于20μLTE,取3μL 用于琼脂糖凝胶电泳验证,其余-20℃保存。
【实验结果与分析】
10 9 8 7 6 M
如图所示,8号为本组实验结果。对比maker,第一条带为正常大肠杆菌基因组,中间可以看见模糊的两条带,可能为断裂的基因组片段,下面最亮的为RNA。出