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文档介绍

文档介绍:第四章 目的基因的获取
目的基因:
准备要分离、改造、扩增或表达的基因。
第四章目基因获取
第四章目基因获取
结构基因的组成
转录启动区
核糖体识别区
编码区
转录终止区
起译码ATG
开读框
休止码TAG、TAA、TGA
第四章目基因获取
目的基因的获取方法
1、直接分离法
2、基因文库分离法
3、PCR分离法
4、化学合成法
比较各种方法获得目的基因的优缺点
第四章目基因获取
第一节 直接分离法
一、限制性内切酶法
用限制性内切酶把基因组DNA切成不同大小的片断。
酶切
第四章目基因获取
由于带有粘性末端,产物可以直接与载体连接。
1. 优点
2. 缺点
目的基因内部也可能有该内切酶的切点。目的基因也被切成碎片!
BamH I
BamH I
BamH I
gene
第四章目基因获取
适合于从简单的基因组中分离目的基因,如质粒或病毒的大小只有几千碱基,大的也超不过几十万碱基,编码基因比较少,获得也比较简单.
应用对象
1、对已定序列的DNA分子,只需要用已知识别序列的限制性内切酶进行一次或几次切割,分离纯化所需要的DN***断,与适当载体连接。
2、对已知定位的目的基因,只要根据目的基因两侧的已知的酶切识别位点,一次就可以获得。
3、即使含目的基因的DNA分子未定序或定位,也只须通过酶切分析,随后再通过部分酶切,构建一个简单的基因文库,从钩出目的基因。
第四章目基因获取
二、随机片断化
1. 限制性内切酶局部消化法
控制内切酶的用量和消化时间,使基因组中的酶切位点只有一部分被随机切开。
① 内切酶识别位点的碱基数
影响所切出的产物的长度和随机程度。
(1)限制性内切酶的选用原则
第四章目基因获取
1)4bp的内切酶
平均每46(4096)bp一个切点。
2)6bp的内切酶
平均每44(256)bp一个切点。
随机程度高。如HaeⅢ、AluI、Sau3A。
② 内切酶粘性末端
能与常用克隆位点相连。
(Sau3A—BamH I)
第四章目基因获取
2. 机械切割法
(1)超声波
超声波强烈作用于DNA,可使其断裂成约300bp的随机片断。
(2)高速搅拌
1500转/分下搅拌30min,可产生约8kb的随机片断。
第四章目基因获取

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