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文档介绍:分子克隆工具酶及其应用
分子克隆工具酶及其应用
分子克隆工具酶及其应用
限制性内切酶—主要用于DNA分子的特异切割
DNA***化酶—用于DNA分子的***化
核酸酶—用于DNA和RNA的非特异性切割
核酸聚合酶—用于DNA和RNA的合成
核酸连接酶—用于DNA和RNA的连接
核酸末端修饰酶—用于DNA和RNA的末端修饰
其它酶类--用于生物细胞的破壁、转化、核酸纯化、检测等。
分子克隆工具酶及其应用
第一节 限制性内切核酸酶
分子克隆工具酶及其应用
一    . 限制性内切酶的发现
1. 细菌限制修饰系统的发现
Werner Arber于1962-1968年发现,1968年分离到I型限制酶。
2. 限制酶HindII的发现
H.O.Smith 和Wilox 于1970年首次从流感嗜血杆菌(H. influenzae)中发现并分离到HindII限制酶。
3. SV40 限制图谱和转录图谱的绘制
D. Nathans(1971年)用HindII绘制SV40的限制酶谱。
分子克隆工具酶及其应用
二  . 限制修饰系统的种类
1. I型:由三个基因构成,hsdR;hsdM;hsdS(host specificity for DNA restriction modification and specificity)位于染色体上,三个基因构成一个复合体,限制酶需要ATP、Mg2+、SAM(5—腺苷甲硫氨酸)。
2. II型:限制与修饰基因产物独立起作用,在E. coli中这两种基因位于质粒上。
3. III型:修饰酶与I型酶相同,hsdM与hsdS基因产物结合成一亚单位,限制酶是独立存在的。
上述三个系统中,只有II型限制酶与***化酶具有相当高的核苷酸识别特异性,因而被广泛用于基因工程中。
分子克隆工具酶及其应用
三. 限制性内切酶的定义、命名
1. 定义:广义指上述三个系统中的限制酶; 狭义指II型限制酶。
2. 命名:限制酶由三部分构成,即菌种名、菌系编号、分离顺序。
 例如:HindⅢ  前三个字母来自于菌种名称H. influenzae,“d”表示菌系为d型血清型;“Ⅲ”表示分离到的第三个限制酶。
EcoRI—Escherichia coli RI
HindⅢ—Haemophilus influensae d Ⅲ
SacI (II)—Streptomyces achromagenes I (Ⅱ)
分子克隆工具酶及其应用
四.限制酶的特点
1. 识别顺序和酶切位点
1)识别4-8个相连的核苷酸
MboI NGATCN;AvaII GG(A/T)CC
BamHI GGATCC:PpuMI PuGG(A/T)CCPy
Not I GCGGCCGC;
SfiI GGCC N N N N N GGCC
CCGGN’N’N’N’N’CCGG
Fok I 5’-GGATG(N)9-3’
3’-CCTAC(N)13-5’ 外侧,产生5’-端突起
2)富含GC
分子克隆工具酶及其应用
3)对称性—双对称
EcoRI 5’-G A A T T C-3’
3’-C T T A A G-5’
4)切点大多数在识别顺序之内,也有例外
5)限制酶切后产生两个末端,末端结构是5’-P和3’-OH
2.  末端种类
1)3’-端突起,个数为2或4个核苷酸
Pst I 5’-CTGCAG-3’ 5’-CTGCA G-3’
3’-GACGTC-5’ 3’-G ACGTC-5’
2)5’-端突起,个数为2或4个核苷酸
EcoRI 5’-GAATTC-3’ 5’-GOH PAATTC-3’
3’-CTTAAG-5’ 3