芝麻发育转录组分析.pdf

文档介绍：中国农业科学 ，：—
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芝麻发育转录组分析
魏利斌 ，苗红梅 ，张 海洋
河 南省 农业 科学 院河 南省芝 麻研 究中心 ，郑 州
摘要：【目的】系统 了解芝麻 发育及种 子形成转录组特征，丰富芝麻 转录组数据信 息。【方法 】选用 份芝麻
样 品个不同芝麻 品种 的完整植株、份不同发育阶段的芝麻籽粒 ，构建转录组测序 文库并进行 —
双端测序及 生物信 息学分析。【结果 】共获得原始数据 ．，有效数据 ．。通过 拼接获得 了长
度大于 的转录物 条 ：／／．．．．／／．，登录 号：一
；转录物总长度 ．，平均长度 ，长度 。转录物注释结果显示，条转
录物序列具有同源 比对信 息；条转录物序 列无 匹配 序列信 息，可能为芝麻特有 的基 因序列。采
用 、功 能分类工具可将 已注释 转录物序列划分为 个或 个功 能类别 ，共涉及 物质及 能量代谢 、信 号传
导 、转录调控及防卫反 应等诸 多生理生化过程。通过 比较不 同材料 间转录物序列及表达水平 ，初步确定 条
序列在 种子形成过程 中表 达量下调 倍 以上 ，条序列仅在 芝麻植 株 中表达 而未在 籽粒 中表达 ；条序列
在种子形成过程中表达量上调 倍 以上，条序列可能与种子形成特异相关。【结论】利用高通量测序技术
对芝麻野生种和不同栽培种现蕾期植株 以及种子形成过程的转录组进行研究，揭示 了芝麻发育转录组的整体表
达特征 ，在得到 大量芝麻 转录组 序 列的同 时，获得 了一批在芝麻 生长发 育及籽粒形成过 程 中有重要功
能的基因序列。为深入开展芝麻生长发育、籽粒发育相关基因功能及调控以及芝麻分子标记开发等研究提供 了
丰富的数据 资源 。
关键词：芝麻；发育；转录组测序；生物信息学分析

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