文档介绍：第三章生物信息学资源与数据挖掘工具一、国外重要生物信息中心一、国外重要生物信息中心 NCBI NCBI ??美国国家生物技术信息中心美国国家生物技术信息中心(National (National Center for Biotechnology Information) Center for Biotechnology Information) ??前身是前身是 NIH NIH 所属的一个研究所的计算生物学所属的一个研究所的计算生物学研究室研究室,1988 ,1988 年独立为年独立为 NCBI, NCBI, 形式上属于国家形式上属于国家医学图书馆医学图书馆(National Library of (National Library of Medicine/NLM) Medicine/NLM) ??管理着许多著名数据库管理着许多著名数据库, ,如如 GenBank GenBank 、、 Medline Medline 、、 dbSNP dbSNP 、、 COG COG 、、 OMIM OMIM 等等??提供提供 Entrez Entrez 、、 BLAST BLAST 等服务等服务?? http:// http:// .gov .gov EBI EBI ??欧洲生物信息学研究所欧洲生物信息学研究所(European (European Bioinformatics Institute) Bioinformatics Institute) ?? 1994 1994 年建于英国剑桥年建于英国剑桥, ,前身是德国海德堡的欧前身是德国海德堡的欧洲分子生物学实验室的信息服务部门洲分子生物学实验室的信息服务部门?? EBI EBI 接收了原来接收了原来 EMBL EMBL 数据库的管理和维护数据库的管理和维护??是欧洲分子生物学网是欧洲分子生物学网( ( ) )的一个特别节的一个特别节点点?? http:// http:// / / ( (主页主页) ) ?? / / ( (工具工具) ) ?? / / ( (服务服务) ) NIG NIG ??日本国立遗传学研究所日本国立遗传学研究所(National Institute (National Institute of ics) of ics) ??创立于创立于 1949 1949 年年7 7月月1 1日日, ,属文部省管辖属文部省管辖??信息服务始于信息服务始于 1984 1984 年年??维护管理着维护管理着 DDBJ DDBJ ?? 1987 1987 年年1 1月发行月发行 DDBJ DDBJ 第一版第一版?? http:// http:// 其他重要中心其他重要中心?? HHMI (Howard Hughes Medical HHMI (Howard Hughes Medical Institute) [ Institute) [ 美美] ] ?? MIPS (Munich Information Center for MIPS (Munich Information Center for Protein Sequences) [ Protein Sequences) [ 德德] ] ?? SIB (Swiss Institute of Bioinformatics) SIB (Swiss Institute of Bioinformatics) [ [瑞士瑞士] ] ?? SWISS-PROT, SWISS-PROT, ExPASy ExPASy , ENZYME, , ENZYME, ……?? NCGR [ NCGR [ 美美], JIPID [ ], JIPID [ 日日], HGMP[ ], HGMP[ 英英], ], BioBase BioBase [ [丹丹], ], ……二、数据库目录二、数据库目录 NAR NAR 数据库专辑数据库专辑??从从 1994 1994 年开始年开始, ,《《核酸研究核酸研究》》杂志杂志( ( Neucleic Neucleic Acids Research) Acids Research) 每年第一期是生物数据库每年第一期是生物数据库专辑专辑??每个专辑大约介绍每个专辑大约介绍 100 100 多种库多种库??从从 2000 2000 年起年起, ,该杂志的出版社该杂志的出版社( (牛津大学出版牛津大学出版社社) )设立了一个数据库目录网页设立了一个数据库目录网页?? http:// http://