文档介绍:四、真核生物的基因转录及其调控
2. 真核RNA聚合酶识别的启动子
(1)RNA聚合酶II识别的启动子(II类启动子,
class II promoters)
与原核基因的启动子最相似
可含有四类元件,前三类是核心启动子(core promoter)的元件
TATA区(TATA box)
起始子(initiator)
下游元件(downstream element)
上游元件(upstream element)
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Class II promoter
Core promoter
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四、真核生物的基因转录及其调控
2. 真核RNA聚合酶识别的启动子
(1)RNA聚合酶II识别的启动子
TATA区(the TATA box)
位于转录起始位点上游约25 bp(以中部计,在酵母中可达50 ~ 70 bp),共同序列为TATAAAA(in the nontemplate strand, similar to prokaryotic -10 box)
功能:确定转录起始位点(一般是TATA区的第一个核苷酸后30 bp);有时甚至是决定整个启动子是否有作用
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四、真核生物的基因转录及其调控
2. 真核RNA聚合酶识别的启动子
(1)RNA聚合酶II识别的启动子
TATA区(the TATA box)
有些基因的TATA区序列与其共同序列相差较大,而只在某些类型的细胞中才表达的基因则有明显的TATA区
有些基因甚至没有TATA区
看家基因(housekeeping genes)
控制发育的基因
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四、真核生物的基因转录及其调控
2. 真核RNA聚合酶识别的启动子
(1)RNA聚合酶II识别的启动子
起始子(initiator)
转录起始位点前后的保守序列
共同序列为:PyPyANT/APyPy
Py: pyrimidine
N: any nucleotide
A: transcription start point
有些基因仅有起始子序列作为其启动子
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四、真核生物的基因转录及其调控
2. 真核RNA聚合酶识别的启动子
(1)RNA聚合酶II识别的启动子
下游元件(downstream element)
某些基因的启动子中存在
位于转录起始位点下游,无共同序列
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四、真核生物的基因转录及其调控
2. 真核RNA聚合酶识别的启动子
(1)RNA聚合酶II识别的启动子
上游元件(upstream element)
在TATA区的上游
GC boxes:富含G和C,如GGGCGG(-47 ~ -61 region, in the coding strand)和CCGCCC(-80 ~ -105 region),可有2个或更多的拷贝
CCAAT box:共同序列为CCAAT
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四、真核生物的基因转录及其调控
2. 真核RNA聚合酶识别的启动子
(2)RNA聚合酶I识别的启动子(I类启动子,
class I promoters)
变化较II类启动子大,无甚保守序列(即随物种而异)
有一定的结构特征
核心元件(core element),转录必不可少
上游控制元件(upstream control element, UCE),高效转录所需
核心元件与上游控制元件之间的距离很重要
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Promoter elements in the human rRNA gene
核心元件(core element)
上游控制元件(upstream control element, UCE)
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Effect of spacing of the two rRNA promoter elements
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