文档介绍：序列分析软件的使用方法
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DNAMAN 是一种常用的核酸序列分析软件。由于它功能强大，使用方便，已成为一种普遍使用的DNA 序列分析工具。
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打开DNAMAN，可以看到如下界面：
第一栏为主菜单栏。除了帮助菜单外，有十个常用主菜单，
第二栏为工具栏：
第三栏为浏览器栏：在浏览器栏下方的工作区左侧，可见Channel 工具条，DNAMAN 提供20 个Channel，点击Channel 工具条上相应的数字，即可击活相应的Channel。
每个Channel 可以装入一个序列。将要分析的序列（DNA 序列或氨基酸序列）放入Channel 中可以节约存取序列时间，加快分析速度。
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如何使用DNAMAN 分析序列
1．将待分析序列装入Channel
通过File Open 命令打开待分析序列文件，则打开的序列自动装入默认Channel。
通过Sequence/Load Sequence 菜单的子菜单打开文件或将选定的部分序列装入Channel 。
通过Sequence/Current Sequence/Analysis Defination 命令打开一个对话框，通过此对话框可以设定序列的性质（DNA 或蛋白质），名称，要分析的片段等参数。
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2．以不同形式显示序列
通过Sequence//Display Sequence 命令打开对话框，
根据不同的需要，可以选择显示不同的序列转换形式。
对话框选项说明如下：
Sequence &Composition 显示序列和成分
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2．以不同形式显示序列
Reverse Complement Sequence 显示待分析序列的反向互补序列
Reverse Sequence 显示待分析序列的反向序列
Complement Sequence 显示待分析序列的互补序列
Double Stranded Sequence 显示待分析序列的双链序列
RNA Sequence 显示待分析序列的对应RNA 序列
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3．DNA 序列的限制性酶切位点分析
将待分析的序列装入Channel，点击要分析的Channel，然后通过Restriction/Analysis 命令打开对话框，
参数说明如下：
Results 分析结果显示
其中包括：
Show summary（显示概要）
Show sites on sequence（在结果中显示酶切位点）
Draw restriction map（显示限制性酶切图）
Draw restriction pattern（显示限制性酶切模式图）
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3．DNA 序列的限制性酶切位点分析
Ignore enzymes with more than（忽略大于某设定值的酶切位点）
Ignore enzymes with less than（忽略小于某设定值的酶切位点）
Target DNA （目标DNA 特性）
Circular（环型DNA），
dam/dcm methylation（dam/dcm ***化）
all DNA in Sequence Channel（选择此项，在Sequence Channel 中的所有序列将被分析，如果选择了Draw restriction pattern，那么当所有的channel 中共有两条DNA 时，则只能选择两个酶分析，如果共有三个以上DNA 时，则只能用一个酶分析。）
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选择所需的项目，然后按提示操作点击按扭，出现下列对话框：
参数说明如下：
Enzyme
代表（enzyme data file），点击旁边的下拉按钮，出现两个默认选项，，
如果添加过自制的酶列表，则附加显示自制酶列表文件名。
数据文件包含180 种限制酶，数据文件包含2524 种限制酶。
选择其中一个数据文件，相应的酶在左边的显示框中列出（按酶名称字母表顺序），鼠标双击酶名称，则对应的酶被选中，在右边空白框中列出。
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