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lasergeneDNAStar 说明书.doc

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lasergeneDNAStar 说明书.doc

文档介绍

文档介绍:

DNAStar中文使用说明书 编者:宋晨 f EditSeq 2
三、 MapDraw 23
四、 MegAlign 32
五、 PrimeiSelect 42
六、 Protean 54
七、 SeqMan II 始 64


2
\ EditSe(
打开已有序列
我们从用苹果计算机打开“TETHIS21MA”和用Windows打开
“tethis21・ seq” 开始。
假设序列的末尾有载体序列污染。我们在用EditSeq打开序列的同时,
用 Set Ends
和3,污染序列。


#


#
从文件菜单(FILE MENU),选择Open。
打开文件夹“Demo Sequences”单击选定蚌列“TETHIS21”。
1^1521^^150)851))
屮850
Renbp
'4 Uli U-i-i-lLiUI^
Lengtli: Mi bD
E)
lean
1 Hl 皿上
•单击位于对话框右下角的Set Ends按
cancel]
钮。Set Ends被打开(如右)。
•在亍框和3,框中键入50和850,点
击血丄单击(墮打开序列。
当EditSeq窗口打开时,序列长度显示在右上角。通过“setting ends, ”
现在你只有最初序列中的801 bp的片段。Set Ends选择在全部


#
Lasergene应用程序中都可以使用。


6
Anatomy of an EditSeq Document
IMA: SEQUENCE

Triplet Indicafor Position/Selection Range
as
Protein/DNA Icon— I〉务 4丨 厲皿伽“:佔4了佔=金石
Il 1 I I I I I 1 1 Pl 1 1 1 I 1 1 I I I I I I I I ! 1 1 ;「I I 0 ■ I Q 1 I I I I 1 I I I I I I I I
801 bp
SKJUENCE
TTTflflflRflTfiRfln盯CCRRTCRGRRCGCRGRRRRRGRRGFHTRTCCRRT CRGATGCTTnTTfifITflGfiRGATflCfiGRTRflCTGGRfiGflGRTRGARflRflfl flGRRflflGGflTflArGCRGRRRflflAflTCflTAATTTfiflTCRAAARRTATfififiT TfiRRAflGfiRfifiRfiRGTfiRRRAATTCCfiTTTfififiTGGCTCCCfiAGfififlGCT
50
100
150
200
Windowpane Divider
COMMENTS
bp Range Feature Key /note Field
LOCUS
DEFINITION macronuclear histone H2B-1 gen ACCESSION
FEATURES
note=-hlstone H2B-1”
TETHIS21Hfl 906 bp ds-DHfl
M31332
183..551 1
IHV
Proofread Aloud
Pause Proofreadi ng
ImRHR |
^/note= 'H2B-1 nRHA (maj or alt.、 3 1 end put ・)”
13+..745 2
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#


#
寻找开放读框
在这入门的一部分中,我们将确定序列中最大的ORF,并翻译它。
• 从 SEARCH MENU 找到 ORF,点 击打开会出现右边的对话框。
•单击Find Next寻找第一个
ORF的位置。
• 继续点击Find Next直到