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核酸检测及相关技术 ppt课件.ppt

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核酸检测及相关技术 ppt课件.ppt

文档介绍

文档介绍:核酸检测及相关技术
基本技术 :核酸提取(DNA/RNA)、鉴定、PCR (RT-PCR/REAL-TIME PCR)、琼脂糖电泳
:基因克隆、转化;SSCP、RELF、杂交(southern/northern、原位杂交)、芯片检测
内容
一、基本技术
(一)核酸提取



(二)PCR扩增


(三)核酸、PCR产物的鉴定


二、相关技术
三、分子平台使用流程及仪器设备操作规范
精品资料
你怎么称呼老师?
如果老师最后没有总结一节课的重点的难点,你是否会认为老师的教学方法需要改进?
你所经历的课堂,是讲座式还是讨论式?
教师的教鞭
“不怕太阳晒,也不怕那风雨狂,只怕先生骂我笨,没有学问无颜见爹娘 ……”
“太阳当空照,花儿对我笑,小鸟说早早早……”
(一)核酸提取
提取DNA目的:
主要是对基因和基因组进行分析。
提取RNA目的:
主要是对基因表达进行分析 。
基因组DNA提取基本步骤
材料准备
破碎、裂解细胞
核酸分离和纯化
沉淀或吸附核酸,去除杂质
核酸溶解在适量缓冲液或水中
组织
培养的细胞
细菌
外周血
(一)基因组DNA提取
组织--匀浆或液氮研磨
培养细胞--蛋白酶K
外周血- - 裂解液
细菌- -裂解液
***仿或吸附柱
异丙醇、吸附柱
70%的乙醇洗涤
蛋白质的去除
盐离子的去除
1、材料准备
基因组DNA
来源:组织/培养的细胞/外周血
最好使用新鲜样本,低温保存的样品不要反复冻融
提取外周血DNA时,要选择有核细胞(单个核细胞)
培养的细胞培养时间不能过长,否则会造成核酸降解
含病毒的标本DNA含量较少,提取前先富集
(一)基因组DNA提取
取组织块 -,,转移到匀浆器中匀浆。
ml离心管中。
加20% SDS 25 μl,蛋白酶K(2 mg/ml)25 μl,混匀。
60 ℃ 水浴1-3 h。
蛋白酶K使多种蛋白质水解,并且蛋白酶K可在SDS存在下有活性。
a 匀浆法
TE缓冲液是弱碱性,对DNA的碱基有保护作用,不易破坏其完整性或产生开环及断裂。
SDS能使DNA和蛋白质分开。
b 液氮研磨法
组织标本的处理:
(一)基因组DNA提取
2、破碎裂解细胞
液氮研磨组织注意事项
确定起始样品量,在研磨前称量好。
研磨过程中要及时添加液氮,边研磨边添加。
可以将研钵放在大小合适的泡沫盒里面研磨,这样可以保温,减小液氮挥发的速度。
研磨成粉末,在液氮挥发尽,应立即加入裂解溶液(裂解溶液一定要含有抗氧化剂,防止DNA被氧化降解。常用的抗氧化剂有PVP,β-巯基乙醇等)。
裂解液加入后继续研磨,直至标本融化成液态。
b 液氮研磨法
培养细胞处理:
将培养细胞悬浮后,用PBS洗涤一次。
离心4000 g,5min,去除上清液。
加10倍体积的裂解缓冲液。
50-55℃水浴1-2 h。
要散细吹胞团块,使细胞被充分裂
(一)基因组DNA提取
破碎裂解细胞