文档介绍：植物蛋白质组学
目录
1. 蛋白质组和蛋白质组学
2. 蛋白质组和基因组
3. 植物蛋白质组研究方法
蛋白质双向电泳
氨基酸序列测定
质谱
生物信息学
4. 植物蛋白质组学研究进展
植物发育蛋白质组学研究
植物环境蛋白质组学研究
磷酸化蛋白质组学研究
5. 植物蛋白质组学研究前景和挑战
表示整体分析以及蛋白质组编目
大规模蛋白质功效研究
建立完整蛋白质调控网络
1. 蛋白质组和蛋白质组学
蛋白质组: 由一个基因组所表示全部蛋白质。
蛋白质组学: 研究在特定时间或环境下某个细胞或某种组织基因组所表示全部蛋白质。它不是根据传统方法孤立地研究某种蛋白质分子功效,而是应用多种蛋白质组学技术研究某种蛋白质在复杂细胞环境中功效。
    蛋白质组学分为表示蛋白质组学和细胞图谱蛋白质组学。前者利用多种优异技术研究蛋白质表示整体改变,即研究在机体生长发育、疾病和死亡不一样阶段中,细胞与组织蛋白质组分改变;后者
关键经过分离蛋白质复合物系统地研究蛋白质间相互作用
蛋白质组和基因组关系: 它们在概念上有相关性, 代表某一蛋白质组蛋白质是由基因组编码, 而基因功效是经过蛋白质表现出来。
蛋白质组学研究远比基因组研究复杂:
（1）蛋白质组复杂性远远高于基因组
一个基因≠一个转录产物≠ 一个蛋白质
基因→不一样转录起始和mRNA剪切→不一样mRNA →不一样翻译起始→不一样蛋白质→翻译后修饰→蛋白质功效、稳定性、细胞定位发生改变
（2）基因组组成是固定, 蛋白质组组成是动态。
基因组在全部细胞中几乎都是相同, 与之不一样, 蛋白质组含有很高细胞和组织特异性。
基因组是相对稳定, 蛋白质组处于高度动态改变之中。
（3）细胞内蛋白质拷贝数（108）远比基因拷贝数大（105）。
（4）基因可采取PCR扩增和自动测序, 而蛋白质还没有这些技术。
蛋白质双向电泳
氨基酸序列测定
质谱技术
生物信息学
蛋白质组研究技术路线步骤图
蛋白质双向电泳
蛋白质双向电泳(2-DE): 依据蛋白质等电点和相对分子质量不一样, 分别经过第一维等电聚焦和第二维SDS聚丙烯酰***凝胶电泳对蛋白质混合物进行分离。
电泳后对蛋白质进行染色, 常见染色方法有考马斯亮蓝染色、银染以及蛋白质荧光检测方法。
蛋白质双向电泳图
利用双向电泳研究植物蛋白质组基础步骤
蛋白样品提取→双向电泳分离蛋白→蛋白质染色→双向电泳图谱分析
→ 蛋白点切割 → 蛋白酶解和判定
该步骤最关键步骤是蛋白质样品提取, 它关系到下游蛋白质分 离和判定是否能够成功。好蛋白质样品要求从某一个细胞、组织或器官中提取尽可能多蛋白质, 以最大程度地反应这个蛋白质组全貌。
双向电泳缺点和处理方法
处理方法:
1. 对样品进行前期分级
2. 对不一样细胞器官或组织进行分离
3. 使用宽胶条, 符合重合窄IPG凝胶
4. 双向荧光差异凝胶电泳
5. 多块胶垂直二维SDS-PAGE系统
6. 双向电泳工作站
缺陷
分辨率低
重复性差
耗时、自动化
程度低
蛋白质
定量困难