文档介绍：系统生物学与信息整合 XXX ?利用蛋白质-蛋白质相互作用的数据,蛋白质配偶的特性来分类蛋白质 ?对 2709 种公开发表的酵母菌 haromyces cerevisiae 的蛋白质之间的相互作用进行综合分析,建立了 1538 种蛋白质之间的 2358 种相互作用的统一的大型网络。?根据蛋白质的相互作用的配偶的已知功能把 2709 种可能的功能判归给蛋白质。?此方法正确地为 72% 的 1393 种有不止一个已知功能的配对者的特征化蛋白质推测了一个功能种类,也用来推测 364 种以前的未特征化的蛋白质的功能。?通过这种方法,网络能准确的推测 72% 的至少带有一个特征性配对者的 1393 种特征性蛋白质。蛋白质从蛋白质相互作用推测 Marcotte 等人的推测? YNR053C RNA 处理/修饰(5/5) 转录,细胞组建,核组建, RNA 接合(5/5) mRNA 转录, mRNA 接合 ( e: 3, p: 1) ? BIR1 细胞周期控制(2/4) - ? CNS1 细胞张力(2/3) ,蛋白质折叠(2/3) 细胞组建,核组建( p:33) ? YGL161C 小泡运输(2/3) ,细胞膜融合(2/3) - ? YIP3 小泡运输(3/3) - ? YMR322C 细胞张力(3/3) - ? YPR105C 小泡运输(2/3) - ? AIP2 细胞极性(2/2) 细胞组建, 碳水化合物利用,碳水化合物代谢, 新陈代谢,发酵; 能量( e:2,p:4) ? DUO1 有丝分裂(2/4) - ? EBS1 碳水化合物新陈代谢(2/5) - 表 1 从蛋白质-蛋白质相互作用预测蛋白质功能与用结合算法( combined algorithm )预测蛋白质功能的比较? FPR4 蛋白质合成(2/3) 细胞组建,转录,核组建 (e:1,two:2) ? GIP2 有丝分裂(2/2) - ? ISA1 蛋白质合成(2/2) 氮硫利用,代谢,氮硫代谢 ( p:2) ? RDI1 细胞极性(2/3) G- 蛋白质( e: 1) ? SMY2 RNA 接合(2/2) 转录;细胞组建, mRNA 接合, 核组建, mRNA 转录( e:1) ? YDR100w 小泡运输(2/2), 细胞质融合(2/2) - ? YEL015W