文档介绍:- -
. 优选-
重要定义1
转换光密度单位的方法如下1
AOI技巧〔灰度值、面积测量〕2
编制宏4
计数8
图象分析策略11
图片的保存13
光密度13
关闭相机的自动白平衡功能15
免疫组化光密度测量16
统计问题21
宏操作22
转换光密度单位→选好待测量的区域 →指定测量工程 →进展测量统计
重要定义:
①把图片中呈现黄色的区域给挑选出来,这局部区域是我们最感兴趣的地方,叫作AOI〔area of interest〕
②图片中被标上红色的区域被定义为一个class,其中每一个独立的小区块被定义为这个class中的一个object。以此图为例,图中深蓝色的局部是细胞核,因此所有的细胞核都被选中成一个class,其中每一个细胞核就是一个object
③在默认的intensity格式中,是图片灰度,越黑数值越小,越白数值越大。而实际上我们测量的染色强度是光密度,染色越深,光密度值越大。需要进展转换图象intensity格式,如果不进展光密度单位的转换,测量的数值将完全是错误的。
转换光密度单位的方法如下:点击:measure--carliberation--intensity,调出intensity校正窗口。然后在窗口中点new按纽,再点一下下面的std optical density选项,这时可以看到窗口中的直线变成了反向的曲线。然后还要点一下最上面的system按纽。最后点close关闭窗口。这样就把程序系统的灰度单位转换成了光密度单位。
将光密度单位设定为system之后就不必再对后面的每一X照片都进展光密度校正了。
- -
. 优选-
AOI技巧〔灰度值、面积测量〕:
〔1〕segmentation工具:面对组织切片中密密麻麻的细胞,就得用本主题讨论的segmentation工具。
正确的操作顺序是:先翻开select measurement,选择好各个测量工程,再回到count/size中点select color进展颜色选取,再回到count/size窗口中点count计数。这样操作完毕后仔细观察一下计算的区域,正是刚刚正确选取的区域了。
①点measure的select measurement ,选中area, density〔mean〕,IOD。
②选manual,并点select color调出segmentation窗口。窗口里有两个表单,一个是color cube based,另一个是histogram based。我们要选取后者,并且使用HSI颜色格式来进展分色选择。当切换到HSI时,会弹出一个窗口提示你会reset颜色选择,是否继续?当然是OK啦。这时的颜色选择全部重置为0-255。在HSI颜色格式中,H为色调,就是我们眼睛所看到的红橙黄绿青蓝紫等。S为色饱和度,I为强度。在选择AOI时,首先保持S、I为最大范围,从H中选择黄色局部。点一下H,直方图显示就是图片各象素H值的分布,在直方图的两边各有一根线,这就是选择线,先将右边的线用鼠标左键向里面拉,拉一点停一下看看效果,可以看到最开场时是选中了全部画面,然后是蓝色的区域慢慢显露出来,并且越显越多,选择线的位置也在下面的窗口中有显示,是0-255之间的数,共有两个窗口,左边是取值下限,右边是取值上限,先不断减小上限值使得非黄色区域不断地显露出来,再不断增加下限值让另一局部非黄色的区域也显露出来。这X照片中黄色区域为H:0-33。色饱和度S与强度I都直接设为0-255。这就是说,只要是黄色,就被认为是阳性表达的区域。